More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0055 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  100 
 
 		 337 aa  692    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  83.09 
 
 		 337 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.09 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  33.87 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  34.46 
 
 		 306 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  31.77 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  34.81 
 
 		 315 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  31.8 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  32.92 
 
 		 327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  31.31 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  30.63 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  50.85 
 
 		 417 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  36.86 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  30.79 
 
 		 331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  31.94 
 
 		 394 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  52.14 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  31.08 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  31.23 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  31.88 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  29.49 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  32.17 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  31.01 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  31.78 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.43 
 
 		 332 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  32.74 
 
 		 301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  26.54 
 
 		 348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.19 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  30.56 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  26.61 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 452 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  41.78 
 
 		 388 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  27.73 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  25.99 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  26.61 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  26.61 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  26.61 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  27.96 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  49.52 
 
 		 235 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  34.06 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 347 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  47.17 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  30.71 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  46.23 
 
 		 432 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.24 
 
 		 438 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 162 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  45.37 
 
 		 491 aa  102  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 378 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  47.52 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.12 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  46.85 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 501 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  51.9 
 
 		 458 aa  100  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  49.06 
 
 		 281 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  50.5 
 
 		 337 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  43.4 
 
 		 368 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.98 
 
 		 388 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  40.17 
 
 		 400 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 502 aa  97.1  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  35.03 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  25.77 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  42.86 
 
 		 475 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 236 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 475 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 475 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 274 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  48.91 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  46.32 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 256 aa  92.8  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  38.02 
 
 		 517 aa  92.8  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 524 aa  92.8  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 472 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 317 aa  92.8  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.8 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  25.48 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  42.86 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  37.98 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  32.72 
 
 		 476 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.28 
 
 		 222 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  45.26 
 
 		 380 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  37.27 
 
 		 227 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  35.61 
 
 		 469 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  35.07 
 
 		 478 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  42.97 
 
 		 177 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 432 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  37.61 
 
 		 467 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  32.72 
 
 		 197 aa  89.7  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 116 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>