75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0051 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  100 
 
 		 521 aa  1018    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  64.46 
 
 		 556 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  42.13 
 
 		 262 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  41.63 
 
 		 312 aa  180  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  44.84 
 
 		 249 aa  179  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  43.38 
 
 		 323 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  42.22 
 
 		 268 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  43.18 
 
 		 234 aa  163  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  38.89 
 
 		 192 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  39.82 
 
 		 238 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  37.45 
 
 		 276 aa  150  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  41.74 
 
 		 218 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  37.02 
 
 		 238 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  36.97 
 
 		 266 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  35.56 
 
 		 260 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  34.22 
 
 		 298 aa  133  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  37.39 
 
 		 229 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  35.74 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  36.05 
 
 		 270 aa  126  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  35.83 
 
 		 353 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  36.12 
 
 		 268 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  37.24 
 
 		 243 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  36.94 
 
 		 368 aa  118  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  34.33 
 
 		 257 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  32.61 
 
 		 242 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  35.98 
 
 		 286 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  39.35 
 
 		 251 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  29.79 
 
 		 236 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  31.08 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  33.58 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  33.58 
 
 		 225 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  30 
 
 		 197 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  36.43 
 
 		 269 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  30.11 
 
 		 200 aa  67  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  40 
 
 		 205 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  28.76 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  36.67 
 
 		 209 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  35.33 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  35.11 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  32.33 
 
 		 187 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  30.46 
 
 		 244 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  32.33 
 
 		 187 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  32.85 
 
 		 267 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  33.59 
 
 		 324 aa  57  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.3 
 
 		 307 aa  56.6  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  32.28 
 
 		 208 aa  56.6  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.16 
 
 		 2449 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  37 
 
 		 218 aa  55.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  31.43 
 
 		 262 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  32.86 
 
 		 207 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  31.25 
 
 		 377 aa  54.7  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  32.52 
 
 		 235 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  30.98 
 
 		 199 aa  54.3  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.95 
 
 		 270 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  27.27 
 
 		 253 aa  52  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  27.34 
 
 		 223 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  27.86 
 
 		 269 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  32.82 
 
 		 291 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  34.15 
 
 		 214 aa  51.2  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  26.96 
 
 		 251 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  32.35 
 
 		 238 aa  50.4  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  33.82 
 
 		 195 aa  50.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  28.09 
 
 		 238 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.91 
 
 		 336 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  26.38 
 
 		 247 aa  49.7  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.89 
 
 		 206 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  27.14 
 
 		 265 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  31.1 
 
 		 328 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  25.41 
 
 		 206 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.41 
 
 		 206 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  36.97 
 
 		 298 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.08 
 
 		 206 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  30.71 
 
 		 207 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  28 
 
 		 196 aa  47.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  29.5 
 
 		 286 aa  43.9  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>