More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0045 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  93.55 
 
 
496 aa  879    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  100 
 
 
496 aa  954    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  51.65 
 
 
529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  50.11 
 
 
470 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  50.64 
 
 
460 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  52.86 
 
 
473 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  48.67 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  52.02 
 
 
470 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  52.02 
 
 
470 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  52.02 
 
 
470 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  50.63 
 
 
543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  49.47 
 
 
470 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  49.37 
 
 
487 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  47.77 
 
 
469 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  49.38 
 
 
498 aa  395  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  52.01 
 
 
493 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  50.33 
 
 
468 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  47.56 
 
 
517 aa  385  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  47.05 
 
 
487 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  51.91 
 
 
459 aa  378  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  48.6 
 
 
533 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  46.94 
 
 
496 aa  368  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  47.36 
 
 
459 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  46.14 
 
 
475 aa  359  6e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  46.74 
 
 
463 aa  358  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  46.56 
 
 
563 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  44.47 
 
 
469 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  40 
 
 
486 aa  347  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  42.98 
 
 
659 aa  347  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  43.25 
 
 
517 aa  345  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  42.41 
 
 
462 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  46.74 
 
 
457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  46.17 
 
 
474 aa  338  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  49.14 
 
 
494 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  44.23 
 
 
463 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  41.87 
 
 
519 aa  292  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  40.97 
 
 
429 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  40.9 
 
 
493 aa  281  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  40.64 
 
 
480 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.9 
 
 
954 aa  270  2.9999999999999997e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.5 
 
 
924 aa  271  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  39.7 
 
 
426 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  42.79 
 
 
435 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  39.68 
 
 
933 aa  251  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  39.8 
 
 
921 aa  247  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  41.14 
 
 
481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  39.37 
 
 
441 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  42.48 
 
 
444 aa  239  9e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  36.81 
 
 
405 aa  223  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  36.17 
 
 
472 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  36.95 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  37.86 
 
 
439 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  37.79 
 
 
480 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  33.75 
 
 
428 aa  203  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  35.05 
 
 
463 aa  199  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  34.52 
 
 
443 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  35.67 
 
 
443 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  33.58 
 
 
422 aa  193  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  32.89 
 
 
422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  33.24 
 
 
399 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  32.15 
 
 
409 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  33.43 
 
 
414 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  31.9 
 
 
409 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  34.57 
 
 
368 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  34.12 
 
 
368 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  34.98 
 
 
423 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  38.19 
 
 
365 aa  160  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  34.02 
 
 
420 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  33.14 
 
 
509 aa  156  7e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  35.5 
 
 
367 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  34.35 
 
 
359 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  36.59 
 
 
375 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  33.04 
 
 
367 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  35.47 
 
 
424 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 
380 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  34.95 
 
 
365 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  37.68 
 
 
364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  32.58 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  35.31 
 
 
387 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  37.67 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  32.75 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  35.74 
 
 
400 aa  146  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  33.8 
 
 
374 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3995  cell cycle protein FtsW  35.71 
 
 
392 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6114  cell division protein FtsW  34.29 
 
 
417 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309326  normal  0.0125207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  34.53 
 
 
403 aa  143  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  34.34 
 
 
412 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4051  cell division protein,FtsW/RodA/SpoVE family  35.76 
 
 
392 aa  143  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1189  cell division protein,FtsW/RodA/SpoVE family  34.74 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  30.92 
 
 
363 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  31.79 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0482  cell division protein FtsW  32.37 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000160421  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  35.05 
 
 
364 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3708  cell cycle protein FtsW  36.45 
 
 
393 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000336622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3691  cell cycle protein FtsW  36.45 
 
 
393 aa  140  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1112  cell division protein FtsW  34.74 
 
 
393 aa  140  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3963  cell division protein,FtsW/RodA/SpoVE family  36.42 
 
 
368 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3384  cell division protein FtsW  35.16 
 
 
395 aa  140  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.319796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  34.28 
 
 
354 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  31.97 
 
 
374 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>