More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0027 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  62.45 
 
 		 513 aa  657    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  62.77 
 
 		 513 aa  655    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  62.77 
 
 		 513 aa  655    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  62.77 
 
 		 513 aa  655    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  62.77 
 
 		 513 aa  655    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  62.45 
 
 		 513 aa  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  66.6 
 
 		 508 aa  654    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  62.77 
 
 		 513 aa  655    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  62.57 
 
 		 513 aa  653    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  62.85 
 
 		 520 aa  661    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  63.64 
 
 		 522 aa  634    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 510 aa  1033    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  81.64 
 
 		 506 aa  822    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  79.18 
 
 		 523 aa  822    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  64.43 
 
 		 517 aa  664    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  74.45 
 
 		 510 aa  746    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  62.45 
 
 		 513 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  96.08 
 
 		 510 aa  974    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  62.77 
 
 		 513 aa  655    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  64.43 
 
 		 518 aa  655    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  62.45 
 
 		 513 aa  657    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  63.71 
 
 		 513 aa  628  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  60.97 
 
 		 537 aa  624  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  63.71 
 
 		 524 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  63.51 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  44.75 
 
 		 625 aa  436  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  44.58 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  45.87 
 
 		 586 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  43.62 
 
 		 612 aa  424  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  41.52 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  44.15 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  40 
 
 		 531 aa  376  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  42.12 
 
 		 516 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  38.64 
 
 		 518 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  41.38 
 
 		 537 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  41.44 
 
 		 550 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  39.03 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  40.47 
 
 		 517 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  39.34 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  40.67 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  39.8 
 
 		 513 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  41.76 
 
 		 527 aa  362  6e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  41.2 
 
 		 530 aa  363  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  39.42 
 
 		 534 aa  362  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  38.87 
 
 		 516 aa  362  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  41.3 
 
 		 518 aa  360  2e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  38.99 
 
 		 517 aa  360  3e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  41.18 
 
 		 527 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  42.34 
 
 		 516 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  40.23 
 
 		 516 aa  360  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  38.31 
 
 		 516 aa  360  4e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  39.11 
 
 		 531 aa  359  5e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  40.41 
 
 		 531 aa  359  7e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  39.54 
 
 		 526 aa  358  9e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  40.67 
 
 		 514 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  39.96 
 
 		 531 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  38.49 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  38.6 
 
 		 512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  40.66 
 
 		 529 aa  356  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  40.08 
 
 		 538 aa  356  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  38.49 
 
 		 515 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  39.69 
 
 		 520 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  38.49 
 
 		 523 aa  354  2e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  37.67 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  39.16 
 
 		 536 aa  355  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  39.84 
 
 		 522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  38.39 
 
 		 519 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  39.77 
 
 		 551 aa  354  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  39.16 
 
 		 514 aa  353  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  40.32 
 
 		 527 aa  353  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  38.96 
 
 		 514 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  40.48 
 
 		 542 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  38.98 
 
 		 513 aa  352  8e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  41.11 
 
 		 559 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  40.15 
 
 		 540 aa  350  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  38 
 
 		 517 aa  350  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  38.31 
 
 		 513 aa  349  6e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  40.79 
 
 		 524 aa  349  6e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  40.38 
 
 		 530 aa  349  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  38.61 
 
 		 510 aa  349  7e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  37.62 
 
 		 517 aa  348  9e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  36.01 
 
 		 515 aa  348  1e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  36.95 
 
 		 521 aa  348  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  40 
 
 		 510 aa  347  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  37.86 
 
 		 517 aa  347  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  39.26 
 
 		 520 aa  347  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  39.77 
 
 		 520 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  39.59 
 
 		 542 aa  346  7e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  38.82 
 
 		 521 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  39.34 
 
 		 532 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  38.65 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  39.72 
 
 		 527 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  39.57 
 
 		 519 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  39.1 
 
 		 538 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  39.57 
 
 		 519 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  37.4 
 
 		 514 aa  344  2e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  39.57 
 
 		 510 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  38.89 
 
 		 536 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  37.88 
 
 		 510 aa  344  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  38.64 
 
 		 522 aa  344  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>