More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0026 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 303 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  90.37 
 
 		 303 aa  521  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  74.42 
 
 		 305 aa  454  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  65.77 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  65.78 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.32 
 
 		 299 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1558  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.88 
 
 		 301 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.953041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1588  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  53.22 
 
 		 301 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1612  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  53.22 
 
 		 301 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4266  pyruvate carboxyltransferase  51.8 
 
 		 317 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0273285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  50.68 
 
 		 315 aa  285  9e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.95 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.32 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  48.3 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  50.34 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  48.81 
 
 		 314 aa  277  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  50.68 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1894  pyruvate carboxyltransferase  50.51 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  51.33 
 
 		 313 aa  275  8e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  45.79 
 
 		 321 aa  271  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  49.32 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4466  pyruvate carboxyltransferase  51.19 
 
 		 301 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.34 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43 
 
 		 303 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.66 
 
 		 303 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  49.49 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.66 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  48.15 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  46.58 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.33 
 
 		 336 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.32 
 
 		 303 aa  262  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.64 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  46.51 
 
 		 317 aa  261  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.14 
 
 		 326 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  47.18 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  46.82 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  48.14 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.8 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  46.74 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.12 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  45.7 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  45.7 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  48.96 
 
 		 306 aa  258  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.13 
 
 		 321 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  48.15 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  48.82 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  46.15 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.74 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.8 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.16 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  44.18 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  48.48 
 
 		 311 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  45.36 
 
 		 320 aa  254  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2326  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.37 
 
 		 315 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1668  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.37 
 
 		 310 aa  254  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  48.26 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  47.81 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1715  pyruvate carboxyltransferase  47.71 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  47.24 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  47.47 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  44.86 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.92 
 
 		 313 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  46.99 
 
 		 307 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  49.34 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  46.31 
 
 		 311 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  46.76 
 
 		 332 aa  251  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  42.81 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.15 
 
 		 295 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  45.7 
 
 		 301 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  46.36 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.49 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  42.95 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  45.7 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  44.56 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  46.84 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.03 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  46.84 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  46.9 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  43.14 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  46.62 
 
 		 307 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  45.45 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.56 
 
 		 299 aa  245  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.93 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.61 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.37 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  46.69 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.44 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.9 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  43.85 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.52 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0312  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.54 
 
 		 306 aa  241  9e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  44.41 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  43.49 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2063  pyruvate carboxyltransferase  43.21 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  47.1 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>