More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0015 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  62.71 
 
 		 877 aa  1054    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  65.14 
 
 		 876 aa  1115    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  61.83 
 
 		 902 aa  1056    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  62.91 
 
 		 886 aa  1077    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 855 aa  897    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  66.23 
 
 		 881 aa  1144    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 860 aa  1752    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  88.75 
 
 		 862 aa  1536    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 903 aa  1098    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 901 aa  1049    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  67.17 
 
 		 836 aa  1132    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  65.51 
 
 		 845 aa  1113    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  55.4 
 
 		 925 aa  967    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 895 aa  1029    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  61.41 
 
 		 916 aa  1073    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  65.28 
 
 		 846 aa  1111    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  62.11 
 
 		 861 aa  1081    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  64.66 
 
 		 858 aa  1104    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  62 
 
 		 906 aa  1075    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 		 885 aa  1002    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 873 aa  1027    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 894 aa  1026    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  58.2 
 
 		 872 aa  1023    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 911 aa  983    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  61.18 
 
 		 871 aa  1032    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 864 aa  592  1e-168  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 802 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 808 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 896 aa  497  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 908 aa  493  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 928 aa  485  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 		 905 aa  482  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 892 aa  476  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 886 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 886 aa  432  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 855 aa  432  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 886 aa  429  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 863 aa  428  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 906 aa  427  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 865 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 		 809 aa  426  1e-118  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 864 aa  426  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 869 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 863 aa  423  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 		 858 aa  419  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 865 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 886 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 865 aa  410  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 799 aa  382  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 799 aa  381  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 799 aa  377  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 		 799 aa  379  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 806 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 771 aa  368  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 808 aa  363  7.0000000000000005e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 877 aa  357  3.9999999999999996e-97  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 816 aa  356  1e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 882 aa  297  6e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 		 881 aa  296  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 881 aa  295  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 885 aa  295  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 881 aa  294  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 881 aa  294  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 881 aa  294  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 881 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 882 aa  292  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 881 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 881 aa  291  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 881 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 881 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 881 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 883 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 		 881 aa  290  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 883 aa  289  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 880 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 881 aa  287  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 880 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 926 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 894 aa  284  4.0000000000000003e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 881 aa  281  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 880 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 881 aa  280  9e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 		 911 aa  279  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 880 aa  278  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 880 aa  277  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 1002 aa  277  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 883 aa  277  7e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 909 aa  277  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 893 aa  276  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2239  valyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 868 aa  275  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659246  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 891 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 903 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5159  valyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 906 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.174874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 1006 aa  272  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0722  valyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 		 895 aa  271  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5430  valyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 905 aa  271  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0396856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12474  valyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 		 876 aa  271  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 		 902 aa  271  5e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2652  valyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 854 aa  270  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.45272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 955 aa  269  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>