56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0006 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  85.07 
 
 
201 aa  255  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  1.27236e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  58.91 
 
 
187 aa  151  6e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  50.29 
 
 
190 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  50.29 
 
 
190 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  50.29 
 
 
190 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  57.26 
 
 
134 aa  140  1e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  56 
 
 
188 aa  138  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  55.12 
 
 
166 aa  138  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  54.35 
 
 
180 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  53.85 
 
 
188 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  54.81 
 
 
185 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  53.9 
 
 
217 aa  133  2e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  59.2 
 
 
143 aa  132  4e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  51.52 
 
 
273 aa  129  2e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  50 
 
 
184 aa  128  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  45 
 
 
188 aa  127  1e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  45.75 
 
 
185 aa  126  2e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06889e-13 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  45.39 
 
 
185 aa  125  4e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  47.33 
 
 
217 aa  125  4e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  50 
 
 
196 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  50.76 
 
 
183 aa  121  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  49.61 
 
 
177 aa  120  1e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  42.86 
 
 
196 aa  120  2e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  49.58 
 
 
173 aa  117  8e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  49.15 
 
 
187 aa  116  2e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  49.52 
 
 
179 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  45.97 
 
 
207 aa  104  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  47.01 
 
 
206 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  44.83 
 
 
164 aa  104  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  50.4 
 
 
171 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  46.62 
 
 
266 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  46.67 
 
 
172 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  40.19 
 
 
173 aa  84.3  1e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  42.31 
 
 
171 aa  80.5  1e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  32.21 
 
 
156 aa  64.3  1e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  26.36 
 
 
155 aa  61.6  6e-09  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  32.98 
 
 
117 aa  54.7  9e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  37.1 
 
 
149 aa  53.1  2e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  25.53 
 
 
153 aa  48.1  8e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  29.35 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.65832e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  29.35 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16141e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  25.53 
 
 
151 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  21.11 
 
 
97 aa  45.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  27.84 
 
 
159 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  32.29 
 
 
105 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  28.16 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  26.32 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  25.87 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  25.23 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  1.88483e-05 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  22.22 
 
 
97 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2033  protein of unknown function DUF1159  32.18 
 
 
153 aa  42  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0187777  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  35.38 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  27.72 
 
 
170 aa  41.6  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  27.94 
 
 
152 aa  41.6  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>