235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_R0025 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_R0025  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0002  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000719363  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0016  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0010  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0003  tRNA-Ile  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000155812  hitchhiker  0.0000000064789 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0024  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00268867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0568  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0003  tRNA-Ile  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0037  tRNA-Ile  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0181  tRNA-Ile  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00212444  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tIle01  tRNA-Ile  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0025  tRNA-Val  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.19601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0013  tRNA-Val  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0041  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0015  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0058  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.185628  hitchhiker  0.000282949 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0063  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0253659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0068  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000051508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0073  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0994061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  85.51 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0019  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0049  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.538867  hitchhiker  0.000544539 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0057  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0062  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0020  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0051  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0059  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0064  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1214  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0005  tRNA-Ile  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125114  hitchhiker  0.00000268461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0027  tRNA-Ile  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0579561  normal  0.867818 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt016  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0660  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.834568  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00235  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00686486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05583  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00137885  normal  0.131541 
 
 
-
 
NC_003295  RS05732  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705135  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_003296  RS05381  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0141064  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0052  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0062  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0071  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00351274  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0079  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0053  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0063  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0071  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00796346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0076  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0014  tRNA-Ile  84.38 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0054  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000352314  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0044  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237492  normal  0.0570511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0063  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000469016  normal  0.343249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0058  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00611811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0047  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0069  tRNA-Ile  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0826408  hitchhiker  0.0022549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0044  tRNA-Ile  84.38 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000172197  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0097  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0092  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0049  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0052  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0057  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0003  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212749  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0056  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00769688  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0043  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.077359  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0053  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1713  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.205594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0007  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000510908  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0054  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0435849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0064  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0010  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.885368  normal  0.217926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0051  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0061  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0029  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.856201  normal  0.110623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0057  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0012  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.453389  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0048  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0031  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0057  tRNA-Val  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.858787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0048  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326347  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0068  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0014  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206822  hitchhiker  0.00501521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0009  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0789863  normal  0.0348926 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00034  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0039  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000583297  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0040  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000809411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0486048  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0054  tRNA-Ile  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0043  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0053  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tVal03  tRNA-Val  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0014  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0467162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4240  tRNA-Asn  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.488670000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4241  tRNA-Asn  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.07501e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0022  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>