More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4062 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  80.62 
 
 
589 aa  971    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  58.94 
 
 
593 aa  713    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  58.82 
 
 
593 aa  707    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  59.72 
 
 
599 aa  683    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  100 
 
 
583 aa  1197    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  51.63 
 
 
588 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  51.76 
 
 
599 aa  545  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  49.47 
 
 
578 aa  530  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  48.39 
 
 
587 aa  530  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  47.77 
 
 
1106 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  46.26 
 
 
579 aa  514  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.09 
 
 
578 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  46.09 
 
 
578 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  46.09 
 
 
578 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 
578 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
578 aa  507  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 
578 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  46.09 
 
 
578 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
578 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 
578 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  44.91 
 
 
594 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  46.8 
 
 
592 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 
578 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 
578 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  46.8 
 
 
592 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  44.29 
 
 
582 aa  498  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 
578 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 
578 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 
578 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  48.02 
 
 
581 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  44.6 
 
 
590 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  46.62 
 
 
579 aa  497  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
580 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  45.05 
 
 
583 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  44.98 
 
 
580 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  46.14 
 
 
590 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  45.03 
 
 
580 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  44.31 
 
 
575 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  44.81 
 
 
576 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  47.97 
 
 
585 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  45.03 
 
 
580 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  46.4 
 
 
576 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
585 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  45.7 
 
 
580 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  44.75 
 
 
578 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  46.28 
 
 
582 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  43.75 
 
 
580 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  43.6 
 
 
617 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 
551 aa  438  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  40.57 
 
 
651 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 
541 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  39.68 
 
 
904 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  39.01 
 
 
667 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  37.72 
 
 
912 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  38.75 
 
 
921 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  39.07 
 
 
909 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  37.61 
 
 
918 aa  364  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  36.83 
 
 
921 aa  354  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  37.59 
 
 
916 aa  353  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  37.95 
 
 
1017 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  36.59 
 
 
936 aa  351  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  36.59 
 
 
936 aa  350  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  35.6 
 
 
915 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  35.6 
 
 
927 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  35.61 
 
 
930 aa  306  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  34.11 
 
 
906 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  46.3 
 
 
1171 aa  289  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  53.18 
 
 
312 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  48.77 
 
 
512 aa  252  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  48.13 
 
 
248 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  48.31 
 
 
257 aa  243  7e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  51.82 
 
 
308 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  47.11 
 
 
325 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  48.09 
 
 
247 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  50 
 
 
320 aa  241  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  50.23 
 
 
314 aa  241  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  47.66 
 
 
270 aa  241  4e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  48.21 
 
 
319 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  48.74 
 
 
510 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  50.67 
 
 
319 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  50.43 
 
 
333 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  46.41 
 
 
255 aa  236  8e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  48 
 
 
324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  52.34 
 
 
314 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
309 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  51.82 
 
 
322 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  39.26 
 
 
311 aa  230  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  42.72 
 
 
305 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  51.61 
 
 
322 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  46.15 
 
 
322 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  49.02 
 
 
312 aa  228  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  43.06 
 
 
924 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  47.27 
 
 
316 aa  227  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  42.55 
 
 
930 aa  227  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  52.61 
 
 
322 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  45.26 
 
 
912 aa  226  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  44.27 
 
 
323 aa  226  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  42.32 
 
 
943 aa  225  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  47.11 
 
 
308 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>