More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4041 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  100 
 
 		 390 aa  761    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.31 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  35.56 
 
 		 364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  30.26 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.39 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  30.81 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  27.02 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.41 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.43 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  30.46 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  27.32 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  28.21 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  28.42 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  24.74 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  27.99 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.37 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.9 
 
 		 399 aa  143  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  28.57 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  31.98 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  25.06 
 
 		 418 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.02 
 
 		 410 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  30.71 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  23.34 
 
 		 389 aa  136  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  23.76 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  24.86 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  25.71 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  26.43 
 
 		 387 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  24.04 
 
 		 448 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  27.76 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  27 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.09 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  23.8 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.67 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  27.6 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  22.64 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  22.74 
 
 		 408 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  25.92 
 
 		 405 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  24.04 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  23.98 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  29.41 
 
 		 385 aa  126  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  30.4 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  30.33 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  29.97 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  23.58 
 
 		 404 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  28.29 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  23.96 
 
 		 391 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  24.36 
 
 		 405 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  28.05 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  26.07 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  22.4 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  27.6 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  22.75 
 
 		 409 aa  119  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  20.24 
 
 		 435 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  24.16 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  23.62 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.13 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  26.74 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  22.25 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  23.08 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  22.03 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0407  ROK family protein  30.31 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  28.03 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  26.82 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  23.62 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  23.55 
 
 		 390 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  28.95 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  27.72 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  24.36 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  25.37 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  24.92 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  21.76 
 
 		 410 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  20.98 
 
 		 404 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  21.39 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  20.62 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  22.28 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  22.32 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  23.42 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  24.12 
 
 		 410 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  24.2 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  25.53 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  20.32 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  23.56 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.48 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  23.16 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  23.32 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  22.97 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  25.51 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  21.88 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4946  ROK family protein  24.66 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  22.6 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4939  ROK family protein  28.85 
 
 		 419 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  25.73 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  20.16 
 
 		 401 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  22.62 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  22.25 
 
 		 400 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  21.53 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  23.47 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  23.83 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  21.69 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>