More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3986 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  100 
 
 
86 aa  170  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  80.95 
 
 
84 aa  136  8.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  70.93 
 
 
86 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
99 aa  114  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  68.29 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  63.95 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  62.79 
 
 
88 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 
93 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 
84 aa  105  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 
90 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 
85 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 
89 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
87 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  63.86 
 
 
93 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  67.09 
 
 
88 aa  104  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  67.9 
 
 
87 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  63.53 
 
 
93 aa  103  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
87 aa  103  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
87 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
87 aa  103  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
87 aa  103  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
87 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
87 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
87 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
87 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
87 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
87 aa  103  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  63.53 
 
 
94 aa  103  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 
91 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 
86 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  60.98 
 
 
93 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  60.71 
 
 
85 aa  101  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  62.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 
84 aa  100  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  63.41 
 
 
87 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0687  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 
85 aa  100  6e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 
102 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 
102 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
96 aa  100  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 
86 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 
85 aa  100  9e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  62.2 
 
 
93 aa  100  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  59.3 
 
 
86 aa  100  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1822  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2268  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00046629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  60 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  60 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  58.82 
 
 
88 aa  99.4  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  61.45 
 
 
96 aa  99.4  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2309  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  60 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  61.9 
 
 
84 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  61.9 
 
 
84 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 
88 aa  99  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  58.82 
 
 
87 aa  98.2  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
94 aa  97.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  67.44 
 
 
86 aa  97.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  58.33 
 
 
85 aa  97.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 
99 aa  97.1  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  55.95 
 
 
85 aa  97.1  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  61.9 
 
 
85 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  58.33 
 
 
84 aa  97.1  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  55.29 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0604  SSU ribosomal protein S17P  58.82 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  59.3 
 
 
86 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  60.76 
 
 
85 aa  95.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  60.49 
 
 
85 aa  94.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  61.9 
 
 
94 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
86 aa  94.4  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 
91 aa  94  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
85 aa  94  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  59.04 
 
 
86 aa  93.6  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  56.47 
 
 
98 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  59.76 
 
 
93 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  55.29 
 
 
98 aa  92  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0235  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0205  30S ribosomal protein S17  57.65 
 
 
88 aa  92.8  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
87 aa  92  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  92  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  54.65 
 
 
86 aa  90.9  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  57.83 
 
 
101 aa  90.1  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
85 aa  90.1  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  55.81 
 
 
86 aa  90.1  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  60.24 
 
 
102 aa  90.1  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  61.9 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  57.83 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1152  ribosomal protein S17  56.1 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000241067  hitchhiker  0.000026776 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  59.04 
 
 
90 aa  90.1  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>