More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3984 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3984  ribosomal protein L24  100 
 
 
122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1274  ribosomal protein L24  66.93 
 
 
127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  47.75 
 
 
115 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  45.13 
 
 
107 aa  84  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 
106 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1563  ribosomal protein L24  44.23 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00170276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  47.32 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  52.56 
 
 
80 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 
80 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  43.24 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  51.28 
 
 
80 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  44.07 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  45.92 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  41.59 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  44.86 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  41.96 
 
 
106 aa  77  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  44.64 
 
 
107 aa  77  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  41.59 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  41.96 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  41.96 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  44.57 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  40.19 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  42.31 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  47.32 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  40.91 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  42.31 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  45.28 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  41.59 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  40.71 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  37.61 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  36.52 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  37.62 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  41.44 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  39.29 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0306  ribosomal protein L24  39.45 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0004461  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  36 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  40.74 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  45.28 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  40.18 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3994  ribosomal protein L24  36.61 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  41.44 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  40.19 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  38.39 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  39.42 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  42.86 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  41.12 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  38.94 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  40.19 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  38.89 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  35.64 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  40.57 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0416  50S ribosomal protein L24P  42.59 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.227235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  40.37 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  39.82 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  39.82 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  44.33 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  36.7 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0878  50S ribosomal protein L24  40.95 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0510214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  39.05 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0290  50S ribosomal protein L24  40.74 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000794802  hitchhiker  0.00000184934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0730  ribosomal protein L24  44.12 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00351151  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  39.22 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  38 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  40.54 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  40.54 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  36.45 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  37.96 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  36.26 
 
 
118 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  36.26 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  36.94 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>