More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3978 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  100 
 
 
168 aa  327  6e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  83.44 
 
 
165 aa  271  3e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  56.55 
 
 
169 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  55.95 
 
 
169 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  55.95 
 
 
169 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  52.5 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 
166 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 
166 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  53.29 
 
 
168 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 
166 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 
166 aa  175  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 
166 aa  175  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  51.88 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  52.8 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  56.69 
 
 
166 aa  171  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  51.23 
 
 
166 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  53.99 
 
 
167 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 
166 aa  168  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 
166 aa  168  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 
166 aa  168  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 
166 aa  168  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 
166 aa  168  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 
166 aa  168  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 
166 aa  168  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 
166 aa  168  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 
166 aa  168  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  55.06 
 
 
163 aa  168  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  53.75 
 
 
168 aa  168  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  52.44 
 
 
168 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 
167 aa  168  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 
166 aa  167  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 
163 aa  167  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
166 aa  167  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  52.44 
 
 
173 aa  167  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 
166 aa  167  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
166 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
166 aa  166  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  53.09 
 
 
167 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
167 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 
166 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
167 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
167 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
167 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
167 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
167 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
167 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
166 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
167 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
167 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
167 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
167 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  51.23 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  52.47 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  53.8 
 
 
163 aa  164  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  52.47 
 
 
166 aa  164  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  56.38 
 
 
163 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 
165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 
165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  52.47 
 
 
167 aa  164  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0618  ribosomal protein S5  52.07 
 
 
169 aa  163  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  52.53 
 
 
163 aa  163  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  52.47 
 
 
167 aa  164  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  54.14 
 
 
197 aa  163  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 
174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  52.56 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 
169 aa  162  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0209  ribosomal protein S5  56 
 
 
153 aa  161  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  51.85 
 
 
167 aa  161  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  51.85 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  51.85 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  51.85 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 
167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  50.6 
 
 
168 aa  160  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  56.13 
 
 
172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  55.33 
 
 
166 aa  160  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  54.67 
 
 
166 aa  160  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  54.67 
 
 
166 aa  160  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  50.62 
 
 
166 aa  159  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 
173 aa  159  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 
172 aa  159  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1850  30S ribosomal protein S5  50 
 
 
177 aa  159  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.697613 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0303  30S ribosomal protein S5  56.94 
 
 
146 aa  158  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.924443  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0443  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 
165 aa  158  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000313397  hitchhiker  0.000112579 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  51.76 
 
 
173 aa  158  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 
163 aa  158  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  48.21 
 
 
168 aa  158  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  50 
 
 
166 aa  157  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  47.62 
 
 
168 aa  157  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  51.3 
 
 
172 aa  157  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  54.73 
 
 
158 aa  157  8e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  49.38 
 
 
167 aa  157  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  48.81 
 
 
171 aa  157  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  49.38 
 
 
167 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  49.38 
 
 
167 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  49.38 
 
 
167 aa  157  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0506  30S ribosomal protein S5  49.71 
 
 
171 aa  156  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  48.75 
 
 
167 aa  156  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0501  30S ribosomal protein S5  49.71 
 
 
171 aa  156  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000846661  normal  0.0709882 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  55.32 
 
 
147 aa  157  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>