More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3972 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  145  2e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  136  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  127  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  83.33 
 
 
72 aa  127  8e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  126  1e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  126  1e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  4e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  3.71749e-08  hitchhiker  4.19913e-09 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3276  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  124  4e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000759571 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3422  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  123  8e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0297  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00110331  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2818  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196542  normal  0.235424 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3755  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0935334  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2738  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3468  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623681  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0335  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170612  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3047  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3623  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000249232  hitchhiker  1.54943e-11 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0348  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3783  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.752054  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0369  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502306  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3725  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0238444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0288  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0270  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712061  normal  0.0408075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04255e-05 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3928  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0071  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358943  hitchhiker  8.45588e-10 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4222  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271914  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2998  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3499  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  80.56 
 
 
72 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1945  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3148  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2611  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.430163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0496  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3296  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0074  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.06677e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  121  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0300  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.94229e-10  hitchhiker  1.61331e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
73 aa  120  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  1.64388e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  121  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.52368e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  120  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  120  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.77018e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  120  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.98783e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  6.23661e-11  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.50239e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.19555e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.31634e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.60601e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.8346e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.87625e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.19097e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  119  1e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.28141e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  7.69266e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.09815e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
75 aa  119  2e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.18167e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.35268e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  117  4e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  117  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  1e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.27108e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  115  1e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.04366e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  116  1e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  1e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  68.06 
 
 
72 aa  116  1e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1637  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  115  1e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  70 
 
 
83 aa  116  1e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.20042e-14  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  69.44 
 
 
73 aa  115  1e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  2e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.18565e-13  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  115  2e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.56493e-07  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  69.86 
 
 
73 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  114  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  7.44837e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.05996e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  115  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.17845e-06  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  4e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  114  4e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  69.44 
 
 
85 aa  114  4e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  4e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  4e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 
73 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
73 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  3.10182e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
73 aa  113  7e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  113  7e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  71.23 
 
 
73 aa  113  7e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  113  7e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 
73 aa  113  8e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0268  translation initiation factor IF-1  79.69 
 
 
78 aa  113  8e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
73 aa  113  8e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  2.96746e-08  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0864  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  113  8e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.177716  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
73 aa  113  8e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  2.65509e-05  hitchhiker  1.4317e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>