More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3966 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  100 
 
 
116 aa  235  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  70.4 
 
 
125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  61.47 
 
 
113 aa  138  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  55.86 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  53.54 
 
 
128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  54.33 
 
 
128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
120 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  54.31 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  55.46 
 
 
120 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 
113 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 
113 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
178 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  51.72 
 
 
168 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  53.45 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  51.72 
 
 
116 aa  127  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
126 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
118 aa  128  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
126 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  53.45 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  52.59 
 
 
126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  51.72 
 
 
139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  53.15 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
141 aa  124  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
132 aa  124  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
132 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
118 aa  124  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
141 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
138 aa  124  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  52.25 
 
 
112 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  52.59 
 
 
137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
132 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
130 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  50.45 
 
 
113 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  54.31 
 
 
117 aa  124  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
131 aa  123  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  51.72 
 
 
131 aa  123  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
131 aa  123  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
131 aa  123  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
131 aa  123  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
131 aa  123  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
131 aa  123  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
132 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
132 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  50.86 
 
 
131 aa  123  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  50.86 
 
 
131 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
131 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
131 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
128 aa  122  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
131 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
131 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
132 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
131 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  49.14 
 
 
140 aa  122  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  54.76 
 
 
127 aa  122  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
117 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
127 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
117 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
137 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
130 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  53.45 
 
 
126 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
117 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  53.85 
 
 
126 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
142 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
142 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
131 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
130 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
130 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  53.45 
 
 
126 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  49.55 
 
 
113 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
136 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  53.45 
 
 
126 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
130 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
129 aa  121  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>