263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3935 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
680 aa  1360    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1091  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  56.78 
 
 
668 aa  755    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.95 
 
 
687 aa  478  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.68 
 
 
687 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.75 
 
 
698 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.21 
 
 
690 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.92 
 
 
687 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.27 
 
 
686 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  38.07 
 
 
695 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.82 
 
 
687 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.07 
 
 
694 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.74 
 
 
690 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.11 
 
 
686 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.79 
 
 
688 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.41 
 
 
687 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37 
 
 
688 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.46 
 
 
694 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.07 
 
 
711 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.07 
 
 
711 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.88 
 
 
691 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.97 
 
 
705 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.57 
 
 
687 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.48 
 
 
702 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.7 
 
 
716 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.79 
 
 
717 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  34.36 
 
 
688 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.22 
 
 
690 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.08 
 
 
697 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.69 
 
 
719 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.29 
 
 
693 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  35.23 
 
 
688 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.24 
 
 
691 aa  409  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.17 
 
 
693 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0291  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.34 
 
 
701 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265784 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.26 
 
 
690 aa  405  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.16 
 
 
679 aa  398  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.4 
 
 
696 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1319  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.95 
 
 
689 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  34.9 
 
 
690 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  33.92 
 
 
696 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  32.5 
 
 
691 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  33.24 
 
 
693 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.16 
 
 
673 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0540  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.22 
 
 
678 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.792152  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  35.64 
 
 
694 aa  391  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.82 
 
 
696 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.95 
 
 
728 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.31 
 
 
697 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.57 
 
 
692 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1266  glycine--tRNA ligase  33.67 
 
 
696 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.26 
 
 
696 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.54 
 
 
692 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.62 
 
 
697 aa  382  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.26 
 
 
692 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.01 
 
 
683 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1195  glycine--tRNA ligase, beta subunit  33.43 
 
 
729 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.46 
 
 
688 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  32.37 
 
 
700 aa  382  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.96 
 
 
689 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0916  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.63 
 
 
694 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.67 
 
 
683 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.57 
 
 
733 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.94 
 
 
692 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.48 
 
 
684 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.02 
 
 
688 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0694  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.83 
 
 
695 aa  368  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.7209  hitchhiker  0.0000422359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
684 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
684 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  32.4 
 
 
688 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
684 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4587  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.09 
 
 
731 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0707  glycine--tRNA ligase  34.8 
 
 
672 aa  365  1e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  32.16 
 
 
688 aa  364  3e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.21 
 
 
684 aa  364  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.04 
 
 
689 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.04 
 
 
689 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.19 
 
 
684 aa  364  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.04 
 
 
689 aa  363  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.04 
 
 
689 aa  363  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  33.04 
 
 
689 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0731  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.6 
 
 
672 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.04 
 
 
689 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.04 
 
 
689 aa  363  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8726  Glycine--tRNA ligase  32.26 
 
 
991 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.89 
 
 
689 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00370  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  33.23 
 
 
694 aa  362  2e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.740961  hitchhiker  0.00000247045 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0994  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.15 
 
 
689 aa  362  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.89 
 
 
689 aa  361  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.34 
 
 
693 aa  361  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.7 
 
 
694 aa  360  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1221  glycine--tRNA ligase  32.84 
 
 
696 aa  360  5e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.09 
 
 
693 aa  360  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.75 
 
 
689 aa  359  8e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2121  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.96 
 
 
1019 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.55 
 
 
701 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0930  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.91 
 
 
697 aa  357  5.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.6 
 
 
689 aa  356  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.6 
 
 
689 aa  356  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.6 
 
 
689 aa  356  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.6 
 
 
689 aa  356  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>