86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3926 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3926  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 127 aa  255  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12390  4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erythritol synthase  47.62 
 
 		 321 aa  62  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6091  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6504  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1389  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.1 
 
 		 225 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1025  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1044  helix-turn-helix domain-containing protein  34.83 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0449357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4530  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  39.34 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  41.38 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1020  XRE family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2505  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.400727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  39.13 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2775  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0026  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153059  normal  0.660956 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2159  Cro/CI family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00000314405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2071  Cro/CI family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0247654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  33.78 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  39.66 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1232  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236768  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1190  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815543  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3923  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.680179  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0329  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3578  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  43.28 
 
 		 543 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0230  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0592162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0586  putative transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.378153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  30.48 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1061  XRE family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.161431  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  26.74 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0753  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.057083  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  26.74 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1154  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000787826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0595  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0473  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 81 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5036  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 166 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0019  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 139 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0558597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3538  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.902272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0016  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000711578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  26.74 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0443  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000554716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 272 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0237  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0026  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  41.82 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  36.36 
 
 		 546 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  30.77 
 
 		 240 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0051  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  31.17 
 
 		 263 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0045  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000742068  hitchhiker  0.0000000000614145 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2892  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203012 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0014  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.881591  normal  0.120221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  40 
 
 		 223 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  40.32 
 
 		 71 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>