More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3846 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  50.88 
 
 		 287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  43.94 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  42.28 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 290 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  40.75 
 
 		 290 aa  231  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  39.3 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  39.52 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 290 aa  225  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 281 aa  225  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  42.61 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 292 aa  222  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  38.7 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  41.24 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  41.92 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 281 aa  218  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  36.3 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  33.22 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  31.49 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  46.21 
 
 		 232 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  29.02 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  29.02 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 200 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  24.75 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  26.07 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  29.38 
 
 		 160 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  44.55 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  26 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 288 aa  99  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  26.44 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 277 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  26.56 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1069  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  41.44 
 
 		 452 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  26.39 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3219  transcription activator effector binding  31.65 
 
 		 160 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1594  transcription activator effector binding  28.66 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1563  transcription activator, effector binding  28.66 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  24.03 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  24.91 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  24.24 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  24.57 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  24.91 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  25.44 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  24.57 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  23.23 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>