More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3631 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  100 
 
 
304 aa  595  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  45.64 
 
 
301 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  44.98 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  42.76 
 
 
302 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  45.45 
 
 
290 aa  236  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  43.19 
 
 
306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  43.75 
 
 
311 aa  235  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  41.89 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  43.19 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  42.52 
 
 
308 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  41.55 
 
 
302 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  41.55 
 
 
302 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  42.23 
 
 
302 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  42 
 
 
309 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  41.61 
 
 
310 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  41.75 
 
 
312 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  45.72 
 
 
310 aa  225  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  42.19 
 
 
304 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  44.95 
 
 
310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  38.99 
 
 
345 aa  222  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  41.06 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  41.81 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  43.43 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  39.74 
 
 
302 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  39.53 
 
 
315 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  41 
 
 
306 aa  218  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  42.19 
 
 
305 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  39.07 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  40.2 
 
 
321 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  42.67 
 
 
306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  40.67 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  40.21 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  41.28 
 
 
311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  41.28 
 
 
311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  41.14 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  40.91 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  41.28 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  41.14 
 
 
298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  41.75 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  41.28 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  41.61 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  42.16 
 
 
305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  40.45 
 
 
313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  41.06 
 
 
302 aa  212  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  40.8 
 
 
298 aa  211  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  39.34 
 
 
308 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  38.26 
 
 
305 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  40.8 
 
 
298 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  38.44 
 
 
304 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  40.8 
 
 
298 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  40.26 
 
 
319 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  41.91 
 
 
315 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  40.47 
 
 
298 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  40.47 
 
 
298 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  40.47 
 
 
298 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  40.47 
 
 
298 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  40.13 
 
 
298 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  37.41 
 
 
305 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.39 
 
 
307 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  39.07 
 
 
306 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  37.25 
 
 
295 aa  206  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  40.67 
 
 
295 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  38.13 
 
 
305 aa  205  9e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  39.6 
 
 
308 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  39.6 
 
 
308 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  40.92 
 
 
302 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  42.47 
 
 
310 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  41.36 
 
 
308 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  41.36 
 
 
308 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  41.36 
 
 
308 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  40.59 
 
 
297 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  39.26 
 
 
307 aa  203  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  36.27 
 
 
307 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  39.14 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  39.14 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  39.14 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  39.14 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  39.14 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  39.19 
 
 
321 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.03 
 
 
305 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  39.33 
 
 
303 aa  198  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  40.75 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  41.28 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  36.96 
 
 
309 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  37.38 
 
 
305 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  38.31 
 
 
307 aa  195  7e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  34.77 
 
 
305 aa  195  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  38.21 
 
 
302 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  37.37 
 
 
304 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  37.37 
 
 
304 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  37.87 
 
 
301 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  36.63 
 
 
314 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  39.87 
 
 
303 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  39.87 
 
 
303 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  39.4 
 
 
303 aa  193  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  37.5 
 
 
317 aa  192  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  36.54 
 
 
313 aa  192  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  40.26 
 
 
297 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  41.2 
 
 
324 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  38.21 
 
 
303 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>