128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3617 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3617  putative oxidoreductase  100 
 
 
353 aa  714    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0110465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0371  putative oxidoreductase  62.89 
 
 
356 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3902  putative oxidoreductase  54.34 
 
 
366 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5123  putative oxidoreductase  54.05 
 
 
354 aa  411  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.121383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03573  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  54.05 
 
 
354 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.360175  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0013  putative oxidoreductase  53.76 
 
 
354 aa  408  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03517  hypothetical protein  54.05 
 
 
354 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.394006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4200  putative oxidoreductase  54.05 
 
 
354 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4056  putative oxidoreductase  53.76 
 
 
361 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0013  putative oxidoreductase  54.05 
 
 
354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0282  putative oxidoreductase  53.45 
 
 
353 aa  378  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  43.63 
 
 
356 aa  285  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.32 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  30.39 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25.36 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  25.42 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.56 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  22.94 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  23.32 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  22.64 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 
393 aa  63.5  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  23.62 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  25.43 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  23.86 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  28.96 
 
 
390 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  24.01 
 
 
392 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  22.91 
 
 
406 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 
374 aa  59.7  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  22.15 
 
 
406 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  22.79 
 
 
403 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.16 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 
455 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  23.71 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  23.71 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.35 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  24.65 
 
 
452 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  22.94 
 
 
378 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.87 
 
 
384 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  22.28 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  22.01 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 
397 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0323  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  20.1 
 
 
409 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  23.29 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  25.36 
 
 
397 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  22.62 
 
 
406 aa  56.2  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2872  monooxygenase family protein  27.22 
 
 
449 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.53 
 
 
382 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  24.21 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  23.27 
 
 
407 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 
394 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.31 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  22.34 
 
 
405 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  24.84 
 
 
375 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  23.96 
 
 
409 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  23.63 
 
 
403 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5221  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  20.35 
 
 
409 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  22.73 
 
 
457 aa  52.8  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  23.96 
 
 
401 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  23.55 
 
 
421 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  23.34 
 
 
547 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  20.11 
 
 
430 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  23.06 
 
 
418 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  23.35 
 
 
379 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  22.16 
 
 
425 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  22.56 
 
 
435 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  23.44 
 
 
443 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.5 
 
 
396 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  22.57 
 
 
400 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  19.31 
 
 
445 aa  50.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.44 
 
 
443 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.74 
 
 
446 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.32 
 
 
445 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  21.08 
 
 
430 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.11 
 
 
449 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.74 
 
 
446 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  21.57 
 
 
398 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  26.49 
 
 
388 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 
399 aa  49.7  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  22.36 
 
 
417 aa  49.3  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  19.89 
 
 
509 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  23.08 
 
 
507 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.94 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  23.2 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  20.47 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  21.25 
 
 
413 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>