216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3602 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  100 
 
 
381 aa  754    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  53.83 
 
 
384 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2253  glycerate kinase  52.25 
 
 
380 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.453069  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  49.07 
 
 
380 aa  350  2e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0612  glycerate kinase 1  50.92 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  46.81 
 
 
378 aa  332  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  49.2 
 
 
380 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  47.32 
 
 
388 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  45.74 
 
 
377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  47.75 
 
 
384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  47.11 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  48.67 
 
 
373 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  44.27 
 
 
378 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  48.67 
 
 
373 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  44.27 
 
 
378 aa  324  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  44.27 
 
 
378 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  46.28 
 
 
387 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  44.74 
 
 
380 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  44.47 
 
 
380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  44.74 
 
 
380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  44.74 
 
 
380 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  45.74 
 
 
382 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  45.74 
 
 
382 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  44.44 
 
 
379 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  44.44 
 
 
379 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  44.18 
 
 
379 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  45.66 
 
 
381 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  44.47 
 
 
380 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  48.6 
 
 
380 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  45.74 
 
 
382 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  44.44 
 
 
379 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  45.74 
 
 
382 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  46.01 
 
 
381 aa  315  8e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  46.81 
 
 
385 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  46.4 
 
 
381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  50 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  45.94 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  46.81 
 
 
381 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  44.95 
 
 
380 aa  312  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  45.92 
 
 
381 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  45.92 
 
 
381 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  45.92 
 
 
381 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  46.28 
 
 
385 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  45.92 
 
 
381 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  46.28 
 
 
381 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  43.09 
 
 
382 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  45.92 
 
 
381 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  45.55 
 
 
379 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  45.63 
 
 
381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  46.54 
 
 
381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  45.91 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  45.14 
 
 
381 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  44.21 
 
 
381 aa  308  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  45.01 
 
 
383 aa  308  8e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1859  glycerate kinase family protein  45.36 
 
 
386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  44.06 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  45.48 
 
 
380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  44.39 
 
 
392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  46.4 
 
 
381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  46.54 
 
 
380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  46.54 
 
 
380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  46.01 
 
 
381 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  48.17 
 
 
381 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  47.89 
 
 
408 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  47.89 
 
 
381 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  47.89 
 
 
408 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  47.89 
 
 
381 aa  299  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  47.61 
 
 
381 aa  299  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  47.89 
 
 
381 aa  299  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  47.89 
 
 
381 aa  299  5e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  43.68 
 
 
380 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  44.13 
 
 
381 aa  298  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  47.61 
 
 
381 aa  298  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  45.72 
 
 
380 aa  298  9e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  45.35 
 
 
388 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  45.35 
 
 
388 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  45.67 
 
 
378 aa  297  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  45.35 
 
 
388 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  43.88 
 
 
380 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  43.86 
 
 
381 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  45.07 
 
 
395 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1926  glycerate kinase  43.72 
 
 
371 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  44.88 
 
 
383 aa  295  7e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  42.89 
 
 
394 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  45.04 
 
 
386 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  42.82 
 
 
381 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  47.18 
 
 
381 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  43.29 
 
 
402 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  43.41 
 
 
394 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  44.13 
 
 
381 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2071  glycerate kinase  47.76 
 
 
377 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000043752  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  44.09 
 
 
384 aa  292  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  43.04 
 
 
402 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  45.74 
 
 
381 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  42.93 
 
 
403 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  42.49 
 
 
394 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  44.54 
 
 
384 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  43.94 
 
 
389 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  42.74 
 
 
380 aa  286  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  43.42 
 
 
389 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>