More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3524 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
158 aa  309  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  45.67 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  27.13 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  31.06 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  29.25 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  23.26 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 
187 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 
138 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
183 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  27.07 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  28.83 
 
 
173 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
207 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
159 aa  54.3  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  25.18 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  29.49 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  32.14 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.93 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.93 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  39.71 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.93 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.93 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.93 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
158 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  22.9 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
160 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
146 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
144 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
164 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 
156 aa  52  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
162 aa  52  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  31.63 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
145 aa  51.2  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
138 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
136 aa  51.2  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  34.07 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  26.42 
 
 
144 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 
144 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
193 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 
177 aa  50.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  26.42 
 
 
144 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
167 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  25.49 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  28.42 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  24.83 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  23.15 
 
 
261 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>