More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3472 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  32.05 
 
 		 239 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  32.05 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  32.05 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  32.05 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  31.62 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  31.74 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.33 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.13 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.27 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.27 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  26.27 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.27 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.27 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.27 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.27 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  30.22 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  29.36 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3001  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 269 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 252 aa  101  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 270 aa  99  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5849  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  27.51 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.44 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 264 aa  95.1  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  25.97 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  27.16 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  27.16 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1287  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>