More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3410 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 245 aa  490  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  37.08 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.75 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1426  transcriptional regulator  40.14 
 
 		 149 aa  123  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117361  hitchhiker  0.00392431 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.75 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.51 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 256 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 248 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  27 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.44 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  32.44 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  32.44 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  32.44 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  32.44 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  32.44 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  32.44 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  31.17 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  29.88 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  28.15 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  29.54 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  29.34 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  29.34 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  29.34 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  29.34 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  29.34 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  29.18 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  28.51 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  28.82 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.86 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.7 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.51 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>