More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3395 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  100 
 
 		 461 aa  912    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  51.56 
 
 		 456 aa  433  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  43.12 
 
 		 453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  35.13 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  31.35 
 
 		 455 aa  216  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  31.02 
 
 		 477 aa  193  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  32.36 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  32.14 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  31.98 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 447 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  30.55 
 
 		 455 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 455 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  27.6 
 
 		 442 aa  160  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 518 aa  156  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 468 aa  156  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  28.7 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 464 aa  153  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 452 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 437 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 462 aa  150  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  29.17 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 454 aa  149  9e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  22.51 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.93 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 448 aa  144  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  28 
 
 		 460 aa  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 454 aa  143  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  26.7 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.81 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 454 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 451 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 460 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 454 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 458 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.76 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  22.45 
 
 		 499 aa  136  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.18 
 
 		 496 aa  136  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 455 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 455 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  28.37 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  25 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 452 aa  133  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 476 aa  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 466 aa  133  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 451 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.14 
 
 		 467 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 457 aa  133  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 460 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  22.98 
 
 		 500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  27.34 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 458 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.65 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  25 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  28.57 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  27.41 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  25.97 
 
 		 448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  21.54 
 
 		 500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>