62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3379 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  280  5.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  50 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  50 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  30.38 
 
 
166 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  47.5 
 
 
174 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  55.88 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  45 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  52.94 
 
 
169 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2950  hypothetical protein  31.03 
 
 
200 aa  47.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149218  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0952  hypothetical protein  31.03 
 
 
200 aa  47.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1633  hypothetical protein  31.03 
 
 
198 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0739  hypothetical protein  31.03 
 
 
202 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0196  hypothetical protein  31.03 
 
 
198 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2887  hypothetical protein  31.03 
 
 
198 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2999  hypothetical protein  31.03 
 
 
198 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0975  hypothetical protein  31.03 
 
 
200 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792265  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2577  hypothetical protein  31.03 
 
 
198 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0434  hypothetical protein  31.03 
 
 
198 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.733468  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3008  hypothetical protein  31.03 
 
 
200 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439263  normal  0.0175775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0658  hypothetical protein  31.5 
 
 
181 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0775789  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0921  hypothetical protein  29.31 
 
 
199 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0917  hypothetical protein  29.31 
 
 
200 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0981814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1000  hypothetical protein  29.31 
 
 
200 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240362  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  43.24 
 
 
172 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0562  hypothetical protein  29.31 
 
 
199 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.034618  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0714  putative signal peptide protein  29.51 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  31.48 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1041  hypothetical protein  29.31 
 
 
199 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  52.94 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2263  hypothetical protein  28.12 
 
 
199 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123196  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4154  hypothetical protein  28.12 
 
 
199 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  47.37 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  35.71 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  35.09 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0843  signal peptide protein  24 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  35.09 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2577  signal peptide protein  29.09 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  29.17 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  45.95 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0772  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
186 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253516  decreased coverage  0.00200061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  44.44 
 
 
167 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  35.71 
 
 
178 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  32.69 
 
 
198 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  47.22 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  47.06 
 
 
173 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  32.69 
 
 
198 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  23.08 
 
 
201 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0902  signal peptide protein  34 
 
 
190 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115807  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  44.74 
 
 
169 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  28.99 
 
 
196 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  37.78 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  21.98 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  24.03 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  37.84 
 
 
165 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  35.94 
 
 
165 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  38.89 
 
 
175 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  38.89 
 
 
175 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  21.98 
 
 
203 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  30.19 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  40.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  40 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  28.33 
 
 
180 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>