More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3013 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3013  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000213425  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0928  cold-shock DNA-binding domain protein  80 
 
 
65 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.57 
 
 
65 aa  91.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  69.84 
 
 
67 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  69.84 
 
 
67 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  64.52 
 
 
66 aa  90.1  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  63.49 
 
 
67 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.49 
 
 
65 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  63.49 
 
 
67 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  61.9 
 
 
67 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.9 
 
 
67 aa  88.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  61.9 
 
 
67 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  61.9 
 
 
67 aa  88.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  61.9 
 
 
67 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 
67 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  61.9 
 
 
65 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  61.9 
 
 
65 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  61.9 
 
 
65 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  68.25 
 
 
67 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  68.25 
 
 
67 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  68.25 
 
 
67 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  68.25 
 
 
67 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  68.25 
 
 
67 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  68.25 
 
 
67 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  68.25 
 
 
67 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705321  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.52 
 
 
65 aa  87.8  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.85 
 
 
66 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2236  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000182228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05490  putative cold-shock DNA-binding domain protein  67.74 
 
 
68 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.94484e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.52 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.21 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0958  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 
68 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000177063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.3 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0979697  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  66.13 
 
 
67 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  60.66 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  61.9 
 
 
65 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  61.9 
 
 
65 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0644  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.73 
 
 
65 aa  84.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  65.57 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 
65 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  64.52 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  67.21 
 
 
68 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  67.21 
 
 
68 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.32 
 
 
65 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
66 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
66 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
66 aa  83.6  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  66.67 
 
 
66 aa  83.6  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  66.67 
 
 
66 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
66 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
66 aa  83.6  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
66 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  63.33 
 
 
83 aa  84  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
66 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0557  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.9 
 
 
67 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  62.9 
 
 
66 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  60.32 
 
 
65 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  60.32 
 
 
65 aa  83.6  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  57.14 
 
 
65 aa  83.6  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  60.32 
 
 
65 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  65 
 
 
66 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.29 
 
 
65 aa  83.6  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0191  cold-shock domain-contain protein  60.32 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  60.32 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  60.32 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.06 
 
 
66 aa  82.8  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  62.3 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.66 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.06 
 
 
66 aa  82.8  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.67 
 
 
67 aa  82.8  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  60.32 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.57 
 
 
66 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.14 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1054  cold shock protein CspA  61.9 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1029  cold shock protein  61.9 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00447e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02738  putative Cold shock-like protein  60.61 
 
 
70 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.33 
 
 
66 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1135  cold shock protein CspA  61.9 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.32 
 
 
65 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  58.06 
 
 
66 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0733  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.3 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000585148  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  63.93 
 
 
66 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  63.93 
 
 
66 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  63.93 
 
 
66 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  63.93 
 
 
66 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0237  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.32 
 
 
66 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692047  hitchhiker  0.0000000000000296416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2222  cold-shock DNA-binding domain protein  61.29 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  63.93 
 
 
66 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0945  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.68 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000276652  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  58.46 
 
 
70 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0880  cold shock protein  60.66 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000035682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0645  cold-shock DNA-binding domain protein  63.93 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  61.29 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  63.93 
 
 
66 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0923  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.68 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000200134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>