More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2757 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
245 aa  500  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
241 aa  228  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
241 aa  228  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
239 aa  223  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
239 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  38.53 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 
242 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 
247 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.62 
 
 
243 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  37.28 
 
 
239 aa  149  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 
252 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
243 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 
246 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 
245 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
225 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
258 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
266 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
256 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.86 
 
 
232 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
240 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
244 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
255 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
248 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 
242 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
242 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 
249 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 
239 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
249 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 
238 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
268 aa  118  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.76 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  30.9 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  31.33 
 
 
239 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  31.33 
 
 
239 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  31.33 
 
 
239 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 
238 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 
261 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 
261 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 
234 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.38 
 
 
239 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  30.9 
 
 
239 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  31.51 
 
 
277 aa  111  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  25.71 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 
270 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1316  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
237 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 
249 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  29.52 
 
 
233 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  29.36 
 
 
232 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2619  transcriptional regulator, GntR family  26.69 
 
 
252 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.37 
 
 
240 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
286 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 
248 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
248 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
232 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  29.82 
 
 
235 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.44 
 
 
246 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
232 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 
252 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  27.71 
 
 
256 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 
257 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  26.69 
 
 
264 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
248 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
234 aa  105  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 
241 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  28.95 
 
 
240 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.95 
 
 
240 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.95 
 
 
240 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
245 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  28.95 
 
 
240 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>