More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2737 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 
308 aa  620  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  40.2 
 
 
735 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  45.14 
 
 
292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  43.57 
 
 
286 aa  232  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  41.2 
 
 
280 aa  229  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  38.08 
 
 
296 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  40.36 
 
 
291 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  39.8 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  43.33 
 
 
310 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  37.13 
 
 
323 aa  203  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  38.36 
 
 
315 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  38.79 
 
 
323 aa  203  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  39.39 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  36.16 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  37.7 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  36.3 
 
 
307 aa  199  5e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  36.82 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  44.24 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  37.21 
 
 
304 aa  192  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  37.21 
 
 
304 aa  192  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  38.11 
 
 
315 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  35.4 
 
 
302 aa  188  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  36.72 
 
 
315 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  35.76 
 
 
323 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  35.28 
 
 
310 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.57 
 
 
750 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  35.31 
 
 
302 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 
323 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 
323 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  34.65 
 
 
302 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  33 
 
 
316 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  35.59 
 
 
310 aa  185  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  34.65 
 
 
302 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  37.04 
 
 
315 aa  185  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  35.64 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  39.07 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  34.63 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1603  protein-export membrane protein SecF  36.4 
 
 
290 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.232098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  34.81 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  37.28 
 
 
303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  35.86 
 
 
304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  39.6 
 
 
315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  37.28 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  37 
 
 
313 aa  182  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  33 
 
 
316 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.66 
 
 
763 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  37.92 
 
 
1029 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  33.45 
 
 
316 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  34.67 
 
 
302 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  35.77 
 
 
306 aa  181  1e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  35.71 
 
 
305 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  32.67 
 
 
316 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  36.56 
 
 
310 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  32.67 
 
 
316 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  35.2 
 
 
318 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  32.67 
 
 
316 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  32.34 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  36.39 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
309 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  38.46 
 
 
315 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  38.46 
 
 
315 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  37.92 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  37.92 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  32.12 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  32.12 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  32.9 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  32.12 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  37.92 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  37.92 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  32.01 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  32.12 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  34.75 
 
 
313 aa  178  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  35.64 
 
 
306 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  32.01 
 
 
316 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  32.01 
 
 
316 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  35.69 
 
 
315 aa  178  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  32.01 
 
 
316 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.12 
 
 
856 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  39.53 
 
 
289 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  33.99 
 
 
322 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  34.04 
 
 
321 aa  177  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  37.46 
 
 
316 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  37.92 
 
 
315 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  38.13 
 
 
315 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  36.82 
 
 
317 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  38.43 
 
 
302 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  33.01 
 
 
310 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  34.54 
 
 
357 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 
322 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1047  preprotein translocase subunit SecF  37.91 
 
 
323 aa  176  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  34.98 
 
 
323 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.48 
 
 
750 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  39.19 
 
 
289 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  37.99 
 
 
323 aa  176  6e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  36.27 
 
 
303 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  39.77 
 
 
314 aa  175  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 
330 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.28 
 
 
759 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.74 
 
 
856 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.28 
 
 
759 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>