More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2730 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 371 aa  733    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  50.41 
 
 		 371 aa  328  7e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  39.14 
 
 		 378 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  37.09 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.1 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.8 
 
 		 379 aa  238  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  37.29 
 
 		 369 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  38.54 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  36.99 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  37.87 
 
 		 379 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  37.87 
 
 		 379 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  36.62 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  34.96 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  37.03 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  37.9 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  34.24 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  36.68 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  37.64 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  42.12 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  38.46 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  39.07 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  39.02 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  38.73 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  36.09 
 
 		 366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  34.6 
 
 		 371 aa  212  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  36.09 
 
 		 366 aa  212  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  34.7 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  38.23 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  34.38 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  38.89 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  33.17 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 		 404 aa  209  7e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  34.24 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  35.11 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  36.39 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  37 
 
 		 371 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  36.8 
 
 		 379 aa  206  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  37.3 
 
 		 382 aa  206  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  35.91 
 
 		 386 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  33.51 
 
 		 390 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  34.65 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  37.05 
 
 		 387 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  35.91 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  37.18 
 
 		 373 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  38.95 
 
 		 367 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  32.79 
 
 		 363 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  35.04 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  34.17 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1604  rod shape-determining protein RodA  41.73 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  34.17 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  36.24 
 
 		 369 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  34.22 
 
 		 372 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  35.55 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  39.83 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  37.07 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  35.06 
 
 		 412 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  35.23 
 
 		 371 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  32.43 
 
 		 417 aa  195  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  34.87 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  35.81 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  32.39 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  35.81 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  34.23 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  35.81 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  39.16 
 
 		 379 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  35.54 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  32.9 
 
 		 401 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  32.84 
 
 		 419 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  33.78 
 
 		 371 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  34.4 
 
 		 382 aa  192  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  34.35 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 367 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 367 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  33.69 
 
 		 370 aa  192  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  34.24 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  31.98 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  35.05 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  34.96 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  33.88 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  33.09 
 
 		 426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  34.52 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  32.29 
 
 		 417 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  32.29 
 
 		 417 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  33.9 
 
 		 378 aa  189  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  34.03 
 
 		 411 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  39.66 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  34.07 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  34.73 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  34.68 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  32.32 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  30.94 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  33.98 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  35.12 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  34.59 
 
 		 373 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  33.16 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>