More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2727 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2727  ribosomal protein L13  100 
 
 
145 aa  293  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000734549  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0015  ribosomal protein L13  72.03 
 
 
144 aa  206  6e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  61.54 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
149 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  55 
 
 
142 aa  177  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
149 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  61.76 
 
 
143 aa  176  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  174  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
143 aa  173  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
142 aa  173  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
143 aa  173  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  58.62 
 
 
145 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  55 
 
 
144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
142 aa  170  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  169  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 
163 aa  169  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  168  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  55 
 
 
142 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  168  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  168  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  168  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  168  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  167  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  167  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 
142 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 
142 aa  167  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  166  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  58.33 
 
 
148 aa  166  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  55.88 
 
 
143 aa  166  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
148 aa  166  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 
144 aa  166  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  55 
 
 
142 aa  166  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  54.29 
 
 
146 aa  166  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 
147 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
147 aa  166  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 
142 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 
142 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  55.15 
 
 
142 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 
142 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 
142 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  55 
 
 
142 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  165  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 
142 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  55 
 
 
142 aa  165  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 
142 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 
142 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 
142 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  165  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 
142 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 
144 aa  165  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 
143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
150 aa  164  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 
142 aa  164  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 
145 aa  164  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  54.41 
 
 
142 aa  164  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 
143 aa  164  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  164  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 
142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 
142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 
143 aa  164  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 
144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 
142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 
142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 
142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  163  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  163  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>