29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2480 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2480  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 239 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 239 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0479  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 239 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2128  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3493  transcriptional regulator, TetR family  20.32 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  19.57 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5867  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0832592  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  16.43 
 
 		 205 aa  42  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4037  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.766436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  18.13 
 
 		 219 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 278 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5677  regulatory protein  25.58 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 278 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 278 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>