214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2467 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  100 
 
 
61 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0633  ribosomal protein L32  69.09 
 
 
63 aa  90.5  7e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  53.33 
 
 
60 aa  73.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  0.00000964737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0497  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 
61 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0527  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 
60 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5920  50S ribosomal protein L32  48.28 
 
 
61 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3466  50S ribosomal protein L32  48.28 
 
 
62 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357647  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5115  50S ribosomal protein L32  48.28 
 
 
62 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0625  50S ribosomal protein L32  49.18 
 
 
61 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3426  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 
60 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3774  50S ribosomal protein L32  48.28 
 
 
62 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3664  50S ribosomal protein L32  48.28 
 
 
62 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416645  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5277  50S ribosomal protein L32  48.28 
 
 
61 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0514  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 
60 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0499  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 
60 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00950666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0311  50S ribosomal protein L32  50.85 
 
 
60 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0425  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 
63 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.311335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1128  ribosomal protein L32  47.46 
 
 
59 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3119  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 
61 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0820  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 
62 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3111  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 
61 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3825  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 
61 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.828831  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4153  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 
61 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.867327 
 
 
-
 
NC_004310  BR1775  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 
59 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1710  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 
59 aa  63.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.142223  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0122  50S ribosomal protein L32  50.91 
 
 
61 aa  63.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4342  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 
61 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 
59 aa  61.6  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1559  ribosomal protein L32  48.21 
 
 
60 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 
61 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 
60 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
58 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
61 aa  57.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1412  ribosomal protein L32  42.62 
 
 
62 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 
60 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0070  ribosomal protein L32  43.1 
 
 
59 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  44.07 
 
 
60 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
60 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
60 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 
61 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 
61 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  48.21 
 
 
61 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  46.67 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  43.64 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1848  50S ribosomal protein L32  40.68 
 
 
59 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1611  50S ribosomal protein L32  38.98 
 
 
60 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0069978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7619  50S ribosomal protein L32P  51.11 
 
 
46 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00560447  normal  0.375625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  38.1 
 
 
59 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  38.71 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0708  50S ribosomal protein L32  50 
 
 
57 aa  50.8  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  38.71 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  38.71 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 
58 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0798  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0775  50S ribosomal protein L32  43.33 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000368381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  40.32 
 
 
59 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0227  ribosomal protein L32  48.98 
 
 
50 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0743  ribosomal protein L32  37.7 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0987  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 
60 aa  50.1  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1953  50S ribosomal protein L32  44.64 
 
 
60 aa  50.4  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000656252  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  41.82 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 
56 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  38.33 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2109  50S ribosomal protein L32  42.37 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2780  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 
56 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0446  50S ribosomal protein L32  47.37 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.735597  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  41.27 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3599  ribosomal protein L32  39.66 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  41.82 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2400  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 
56 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000318296  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2470  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 
56 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000146933  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0077  50S ribosomal protein L32  46.3 
 
 
57 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000137918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2562  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 
56 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000144666  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1085  ribosomal protein L32  44.83 
 
 
57 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444858  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1237  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.409262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1599  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 
56 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000342659  hitchhiker  0.00352794 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1913  50S ribosomal protein L32P  43.55 
 
 
62 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  43.64 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2764  ribosomal protein L32  45.65 
 
 
46 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1712  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 
56 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0952  ribosomal protein L32  40 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000023662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1755  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 
56 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000534053  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2297  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000139706  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1598  50S ribosomal protein L32P  42.11 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.208872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  37.29 
 
 
61 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2652  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 
56 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000778579  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1715  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 
56 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000625062  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1490  50S ribosomal protein L32  45.83 
 
 
48 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.334451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1578  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 
56 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000427195  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0576  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.194083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1425  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 
59 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249628  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  45.45 
 
 
56 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 
57 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 
57 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  43.64 
 
 
57 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>