More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2367 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2367  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 
144 aa  288  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0207637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 
146 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 
144 aa  176  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.86 
 
 
145 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  60.15 
 
 
145 aa  166  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 
142 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 
142 aa  151  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
144 aa  150  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
144 aa  150  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
149 aa  146  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.8 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
146 aa  143  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.92 
 
 
147 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.35 
 
 
160 aa  142  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 
156 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1198  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 
141 aa  142  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.61 
 
 
145 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 
156 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 
156 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
146 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
146 aa  139  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
146 aa  139  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
146 aa  139  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
146 aa  139  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
146 aa  139  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
146 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.53 
 
 
184 aa  138  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
150 aa  138  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
144 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 
159 aa  138  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 
160 aa  137  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
146 aa  137  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 
148 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 
149 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 
152 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 
156 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 
151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
157 aa  134  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 
150 aa  134  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 
149 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 
152 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 
151 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 
151 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 
151 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 
148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.94 
 
 
155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0209  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
155 aa  133  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0306548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 
145 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.14 
 
 
144 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 
149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
144 aa  130  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  43.75 
 
 
148 aa  130  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 
147 aa  130  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 
150 aa  130  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  46.26 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 
160 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.85 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  47.41 
 
 
151 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  45.07 
 
 
151 aa  129  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 
193 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  43.17 
 
 
151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 
193 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  43.54 
 
 
159 aa  127  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45 
 
 
137 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  43.54 
 
 
159 aa  127  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  43.17 
 
 
191 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0659  dehydroquinase class II  44.44 
 
 
296 aa  127  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.969624  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
193 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
193 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  45.59 
 
 
149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  48.06 
 
 
145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  43.8 
 
 
145 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 
145 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 
145 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  42.86 
 
 
159 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.23 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  49.23 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  42.45 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.44 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>