More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2347 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  100 
 
 		 466 aa  922    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  34.06 
 
 		 454 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  35.75 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  32.17 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  36.62 
 
 		 455 aa  274  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  34.87 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  34.71 
 
 		 455 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  34.71 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  34.49 
 
 		 454 aa  266  8.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  32.1 
 
 		 449 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  35.21 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  35.59 
 
 		 455 aa  259  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  34.44 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  31.98 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  31.35 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  32.41 
 
 		 464 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  34.66 
 
 		 461 aa  235  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  31.77 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 447 aa  229  7e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  30.24 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 493 aa  226  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  32.5 
 
 		 456 aa  216  5e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 460 aa  216  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  29.31 
 
 		 496 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  31.03 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  32.53 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  31.09 
 
 		 447 aa  203  5e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  29.09 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 466 aa  190  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  27.81 
 
 		 466 aa  190  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 439 aa  182  8.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 440 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 470 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  28.44 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  30.19 
 
 		 451 aa  180  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  30.54 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  31.81 
 
 		 466 aa  176  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 458 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  29.54 
 
 		 496 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  28.24 
 
 		 472 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.8 
 
 		 472 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.49 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 450 aa  171  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  25.06 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  27.65 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  29.68 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  27.78 
 
 		 450 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  26.68 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  27.43 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  26.98 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  26.98 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  27.19 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.44 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  26.13 
 
 		 443 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  27.7 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 452 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  24.38 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  24.83 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  26.98 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 451 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  24.6 
 
 		 451 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  23.62 
 
 		 448 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  25.27 
 
 		 448 aa  156  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 451 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 462 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 444 aa  150  6e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  24.95 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  23.3 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.41 
 
 		 459 aa  143  7e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  27.64 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 451 aa  139  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 472 aa  137  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  21.73 
 
 		 464 aa  137  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  23.61 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  26.65 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 467 aa  134  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>