More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2324 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
223 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.11 
 
 
224 aa  338  2.9999999999999998e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 
228 aa  244  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 
224 aa  244  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  49.32 
 
 
224 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 
226 aa  238  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 
227 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 
224 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 
224 aa  224  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 
228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  51.35 
 
 
226 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 
226 aa  215  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 
228 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 
229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 
224 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  45.61 
 
 
241 aa  210  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  44.05 
 
 
229 aa  209  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  50 
 
 
225 aa  208  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 
227 aa  208  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 
230 aa  208  6e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 
229 aa  207  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 
236 aa  207  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 
225 aa  207  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 
224 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 
223 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  42.04 
 
 
230 aa  204  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 
229 aa  204  8e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 
230 aa  204  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 
226 aa  203  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 
227 aa  203  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 
233 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 
231 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 
224 aa  203  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 
231 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  42.53 
 
 
224 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 
230 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 
227 aa  202  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  45.7 
 
 
219 aa  201  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 
219 aa  201  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 
230 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 
224 aa  201  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 
230 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 
230 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  42.53 
 
 
224 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
225 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 
231 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  43.24 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  44.1 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  44.1 
 
 
235 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  44.1 
 
 
235 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  44.1 
 
 
235 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  44.1 
 
 
235 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  44.1 
 
 
235 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  44.1 
 
 
235 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  44.1 
 
 
235 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  44.1 
 
 
235 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.33 
 
 
225 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  42.54 
 
 
246 aa  199  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 
224 aa  198  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
224 aa  198  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 
239 aa  198  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 
239 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 
239 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 
239 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  47.62 
 
 
239 aa  198  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  47.62 
 
 
239 aa  198  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 
239 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 
223 aa  198  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 
225 aa  198  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  46.26 
 
 
226 aa  198  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 
235 aa  198  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  44.1 
 
 
236 aa  197  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 
233 aa  197  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 
242 aa  197  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 
224 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 
224 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  43.44 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  48.93 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  48.93 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>