More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2275 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  100 
 
 
191 aa  387  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0996  translation elongation factor P  82.63 
 
 
190 aa  328  2e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  47.4 
 
 
211 aa  153  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  42.35 
 
 
185 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  43.62 
 
 
185 aa  151  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  42.55 
 
 
185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  40.54 
 
 
190 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  39.89 
 
 
184 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  40.43 
 
 
184 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  43.46 
 
 
186 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  39.89 
 
 
184 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  39.89 
 
 
184 aa  147  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  42.33 
 
 
185 aa  147  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  38.83 
 
 
184 aa  147  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  40.43 
 
 
185 aa  147  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  41.27 
 
 
185 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  40.31 
 
 
186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  38.42 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  42.02 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  42.93 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  41.36 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  40.96 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  44.21 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  39.68 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  40.74 
 
 
185 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  43.16 
 
 
186 aa  145  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  43.68 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  38.83 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  43.46 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120633  unclonable  0.00000167912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  44.16 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  46.71 
 
 
185 aa  144  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  39.89 
 
 
184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  38.62 
 
 
185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  38.74 
 
 
187 aa  143  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  40.96 
 
 
185 aa  143  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  40.21 
 
 
185 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  38.74 
 
 
187 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  40.96 
 
 
185 aa  142  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  46.71 
 
 
189 aa  142  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  41.36 
 
 
188 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  40.43 
 
 
187 aa  141  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  38.62 
 
 
186 aa  141  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  40.21 
 
 
185 aa  141  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  38.59 
 
 
190 aa  141  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  40.43 
 
 
187 aa  141  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  41.36 
 
 
186 aa  141  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  43.51 
 
 
199 aa  141  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  44.08 
 
 
186 aa  141  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  38.83 
 
 
187 aa  141  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  38.42 
 
 
187 aa  140  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  45.39 
 
 
187 aa  140  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  39.27 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  37.77 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  41.58 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  41.8 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  41.05 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  39.89 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  39.79 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  39.89 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  38.62 
 
 
187 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  42.21 
 
 
187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  39.36 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  38.1 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  41.58 
 
 
186 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  40.96 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  40 
 
 
187 aa  138  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  42.02 
 
 
185 aa  138  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  40.84 
 
 
186 aa  138  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  0.0000774708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  38.83 
 
 
187 aa  137  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  37.57 
 
 
185 aa  137  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  37.57 
 
 
185 aa  137  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  38.3 
 
 
185 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  40.23 
 
 
191 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  40.21 
 
 
185 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  46.05 
 
 
185 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  41.36 
 
 
186 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000014351  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  40.21 
 
 
185 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  38.71 
 
 
216 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  36.7 
 
 
184 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  37.23 
 
 
184 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>