More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2258 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 		 456 aa  930    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0643  RNA methyltransferase, TrmA family  51.51 
 
 		 466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2370  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  48.02 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2082  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  48.02 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  44.75 
 
 		 463 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  46.7 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0994  RNA methyltransferase, TrmA family  40.58 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0406  RNA methyltransferase  42.46 
 
 		 387 aa  311  2e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.59395  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  32.5 
 
 		 482 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  34.5 
 
 		 456 aa  260  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  33.47 
 
 		 488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  34.39 
 
 		 476 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  35.07 
 
 		 466 aa  253  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  32.35 
 
 		 488 aa  252  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  35.51 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  33.57 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  35.78 
 
 		 479 aa  246  6e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  31.11 
 
 		 478 aa  246  6e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.14 
 
 		 477 aa  243  6e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  33.73 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  35.32 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  35.22 
 
 		 448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  30.56 
 
 		 471 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  37.76 
 
 		 472 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 453 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 453 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  32.79 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  30.99 
 
 		 453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  35.26 
 
 		 481 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  31.24 
 
 		 480 aa  236  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  34.25 
 
 		 476 aa  236  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  34.63 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  30.79 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  33.56 
 
 		 468 aa  234  3e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  32.16 
 
 		 457 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  31.6 
 
 		 479 aa  233  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  34.92 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  32.24 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  32 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  31.91 
 
 		 460 aa  229  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  33.1 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  33.17 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  29.62 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  31.38 
 
 		 451 aa  227  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  31.37 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  33.25 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  30.5 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.37 
 
 		 455 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  32.56 
 
 		 471 aa  219  6e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  32.79 
 
 		 470 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  32.18 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  29.04 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  32.33 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  29.04 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  30.85 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  28.81 
 
 		 458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  29.04 
 
 		 458 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  31.34 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  29.04 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  29.04 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  27.25 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  29.04 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  28.74 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  28.81 
 
 		 458 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  28.81 
 
 		 458 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  28.81 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  30.22 
 
 		 536 aa  209  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.21 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  30.77 
 
 		 572 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  29.8 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  28.07 
 
 		 489 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  30.16 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  30.84 
 
 		 554 aa  204  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  30.2 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  30.18 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  28.34 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  30.18 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  30.18 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.18 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.18 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  30.09 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.95 
 
 		 459 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  30.65 
 
 		 458 aa  199  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  29.93 
 
 		 459 aa  199  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  29.93 
 
 		 459 aa  199  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  28.54 
 
 		 438 aa  199  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.74 
 
 		 456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  28.57 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  27.83 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  28.44 
 
 		 485 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.04 
 
 		 458 aa  196  7e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  29.26 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  29.62 
 
 		 493 aa  192  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  30.75 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.81 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.17 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  27.31 
 
 		 455 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  28.28 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  28.57 
 
 		 457 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>