More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2113 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 416 aa  834    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1913  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.22 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0054  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.37 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.45 
 
 		 416 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.93 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.33 
 
 		 419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 419 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.09 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.06 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.81 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 423 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.82 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.26 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1775  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.57 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.78 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  47 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 		 431 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.24 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.48 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.95 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.68 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  45.71 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.48 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.11 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.87 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.39 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.48 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.13 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.11 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  45.71 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.35 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.95 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.63 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.87 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.13 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.95 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.24 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.18 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.89 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.63 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.44 
 
 		 428 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.95 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.95 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.99 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.98 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.39 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  44.87 
 
 		 809 aa  365  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.91 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.76 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.91 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.9 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.93 
 
 		 591 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.1 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.76 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.26 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 		 427 aa  365  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 		 426 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 422 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.15 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.57 
 
 		 428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 423 aa  362  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 		 430 aa  362  8e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.44 
 
 		 431 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.51 
 
 		 422 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.15 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.44 
 
 		 431 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.26 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 422 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.46 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.21 
 
 		 422 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.97 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 421 aa  360  3e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 428 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.91 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.43 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 		 427 aa  360  4e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.45 
 
 		 430 aa  359  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.39 
 
 		 432 aa  360  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 		 430 aa  359  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  45 
 
 		 428 aa  358  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.71 
 
 		 433 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 		 425 aa  358  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.94 
 
 		 432 aa  358  9e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.36 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.61 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.89 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.04 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 		 431 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.3 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.02 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 426 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>