More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2070 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2070  serine dehydratase alpha chain  100 
 
 		 403 aa  822    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3034  L-serine ammonia-lyase  55.39 
 
 		 410 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0084  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  53.25 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3111  L-serine ammonia-lyase  51.01 
 
 		 404 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0917  serine dehydratase alpha chain  51.65 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1327  serine dehydratase alpha chain  48.98 
 
 		 410 aa  385  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016553 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3112  serine dehydratase alpha chain  45.11 
 
 		 410 aa  342  9e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0667312  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  42.76 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  42 
 
 		 458 aa  316  4e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  41.78 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  42.26 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  41.87 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  41.87 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  41.41 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  41.25 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  41.56 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  42.09 
 
 		 458 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  40.49 
 
 		 458 aa  305  7e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  42.09 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  40.44 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  40.26 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  41.87 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  40.76 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  41.43 
 
 		 458 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  41.43 
 
 		 458 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  41.5 
 
 		 462 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  40.66 
 
 		 461 aa  301  9e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  41.32 
 
 		 462 aa  302  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1343  L-serine dehydratase 1  40.31 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  41 
 
 		 470 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  40.53 
 
 		 460 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  41.72 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0687  L-serine dehydratase 1  40.09 
 
 		 453 aa  300  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02979  L-serine dehydratase 3  40.62 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3300  L-serine ammonia-lyase  40.62 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1241  L-serine dehydratase 1  39.11 
 
 		 456 aa  300  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.341866  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02930  hypothetical protein  40.62 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  40.49 
 
 		 461 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1601  L-serine ammonia-lyase  40.22 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0586  L-serine dehydratase 1  40.62 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0995  L-serine ammonia-lyase  40.71 
 
 		 490 aa  299  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4425  L-serine ammonia-lyase TdcG  40.89 
 
 		 456 aa  299  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0116  L-serine dehydratase 1  41.01 
 
 		 460 aa  299  5e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3408  L-serine ammonia-lyase TdcG  40.62 
 
 		 456 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3245  L-serine ammonia-lyase TdcG  40.62 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.346654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0396  L-serine ammonia-lyase  40.71 
 
 		 545 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3586  L-serine dehydratase tdcG  40.62 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  41.06 
 
 		 458 aa  299  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1970  L-serine ammonia-lyase  40.83 
 
 		 454 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0864  L-serine dehydratase 1  40.62 
 
 		 455 aa  299  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  40.58 
 
 		 455 aa  299  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2940  L-serine dehydratase 1  40.04 
 
 		 455 aa  298  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.544189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1863  L-serine ammonia-lyase  40.71 
 
 		 504 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5127  L-serine dehydratase 1  40.53 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  41.06 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  40.31 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5152  L-serine dehydratase 1  40.53 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  40.66 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  40.27 
 
 		 455 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1928  L-serine dehydratase 1  40.31 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2027  L-serine ammonia-lyase  40.61 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2223  L-serine dehydratase 1  40.52 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3215  L-serine dehydratase 1  40.53 
 
 		 529 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2810  L-serine dehydratase 1  40.35 
 
 		 461 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1305  L-serine ammonia-lyase  40.61 
 
 		 454 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0226237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1490  L-serine ammonia-lyase  40.61 
 
 		 454 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  40.84 
 
 		 462 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  39.21 
 
 		 462 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  40.39 
 
 		 454 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1966  L-serine ammonia-lyase  40.61 
 
 		 454 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  39.41 
 
 		 499 aa  296  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  40.39 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0591  L-serine dehydratase 1  40.67 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  40.39 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  40.39 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3598  L-serine ammonia-lyase  40.76 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.842995  normal  0.929959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  40.39 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  40.39 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  40.39 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  40.39 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  40.39 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1955  L-serine ammonia-lyase  40.49 
 
 		 504 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  40.27 
 
 		 455 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  42.67 
 
 		 458 aa  296  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  40.48 
 
 		 462 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  39.69 
 
 		 459 aa  296  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  40.84 
 
 		 458 aa  296  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3535  L-serine ammonia-lyase  40.53 
 
 		 454 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5047  L-serine dehydratase 1  40.44 
 
 		 464 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.533739  normal  0.269496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5070  L-serine dehydratase 1  40.53 
 
 		 461 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  40.84 
 
 		 458 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4547  L-serine dehydratase 1  40.53 
 
 		 461 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  40.71 
 
 		 457 aa  295  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4061  L-serine ammonia-lyase 2  40.27 
 
 		 455 aa  295  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  40.97 
 
 		 463 aa  295  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2383  L-serine ammonia-lyase  39.82 
 
 		 454 aa  295  9e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3431  L-serine ammonia-lyase  40.76 
 
 		 454 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  39.21 
 
 		 462 aa  295  9e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3502  L-serine ammonia-lyase  40.76 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  39.69 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>