195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2042 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
220 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  49.77 
 
 
220 aa  204  8e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
156 aa  90.9  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 
157 aa  88.2  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
154 aa  85.9  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  38.39 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
154 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  36.13 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  30.71 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 
138 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
138 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
161 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
154 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
139 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
159 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
139 aa  62  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
140 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
168 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
159 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
149 aa  61.6  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
139 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
150 aa  60.1  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
161 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
155 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
152 aa  58.9  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 
146 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
139 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 
156 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
142 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 
138 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
171 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 
159 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
147 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
153 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
153 aa  55.1  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 
153 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
149 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
160 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
160 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 
160 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
153 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 
160 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 
160 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
156 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
160 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
160 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
160 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 
160 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
160 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
165 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
162 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
165 aa  52  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  25.45 
 
 
151 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.26 
 
 
147 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  27.66 
 
 
169 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 
142 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  33.64 
 
 
148 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
157 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  21.82 
 
 
151 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
135 aa  48.9  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 
141 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
151 aa  48.5  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
141 aa  48.5  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
148 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
145 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
156 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
189 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  26.13 
 
 
148 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
146 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
159 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 
174 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 
150 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
142 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.69 
 
 
283 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 
149 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  23.14 
 
 
157 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 
145 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 
145 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
157 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  23.71 
 
 
164 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  23.23 
 
 
147 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
148 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
165 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>