More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2031 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  72.34 
 
 		 422 aa  645    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  872    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  62.2 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 423 aa  531  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 424 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 424 aa  521  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 424 aa  519  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  58.73 
 
 		 424 aa  518  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  58.77 
 
 		 422 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  58.73 
 
 		 424 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 424 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 425 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  58.65 
 
 		 420 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  58.77 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 424 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 424 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 427 aa  512  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 423 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 421 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  56.6 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  57.58 
 
 		 422 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 425 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  57.79 
 
 		 422 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 422 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 427 aa  504  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 427 aa  494  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 426 aa  497  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 424 aa  498  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 424 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 425 aa  491  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  58 
 
 		 425 aa  491  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  55.95 
 
 		 424 aa  487  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 425 aa  482  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 423 aa  481  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 425 aa  482  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 426 aa  479  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 425 aa  478  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 421 aa  474  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 432 aa  476  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 425 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 427 aa  474  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 423 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 426 aa  458  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 428 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1666  seryl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.746595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 426 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 421 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1697  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 426 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0685581 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 469 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>