More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2011 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  58.6 
 
 
665 aa  758  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
676 aa  1380  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  38.55 
 
 
751 aa  407  1e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.53 
 
 
765 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  39.3 
 
 
661 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  38.07 
 
 
648 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  36.92 
 
 
806 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  37.46 
 
 
656 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.5 
 
 
618 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.22 
 
 
640 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  36.23 
 
 
662 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  35.54 
 
 
667 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.45418e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  35.62 
 
 
643 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  35.62 
 
 
643 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  37.62 
 
 
640 aa  365  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  36.57 
 
 
654 aa  365  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.35 
 
 
761 aa  365  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  37.03 
 
 
642 aa  363  4e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  37.98 
 
 
709 aa  363  7e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  35.69 
 
 
643 aa  363  7e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  37.4 
 
 
642 aa  363  7e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.59 
 
 
646 aa  362  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.46416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  36.26 
 
 
727 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  35.41 
 
 
727 aa  360  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  35.41 
 
 
727 aa  360  7e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  37.44 
 
 
727 aa  358  2e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  35.54 
 
 
693 aa  358  2e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.43648e-11  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.23 
 
 
905 aa  357  3e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  37.91 
 
 
728 aa  357  4e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  36.82 
 
 
625 aa  357  4e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  37.05 
 
 
744 aa  356  7e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.66 
 
 
648 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  35.24 
 
 
638 aa  353  4e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  36.93 
 
 
701 aa  353  8e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.78 
 
 
734 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  34.89 
 
 
739 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  36.87 
 
 
732 aa  351  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  35.7 
 
 
734 aa  350  4e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  34.47 
 
 
679 aa  350  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  34.98 
 
 
687 aa  349  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  36.65 
 
 
712 aa  347  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  34.91 
 
 
829 aa  347  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  37.46 
 
 
712 aa  346  8e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  34.36 
 
 
720 aa  346  8e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  34.74 
 
 
704 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  35.68 
 
 
681 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  35.3 
 
 
735 aa  343  8e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  34.97 
 
 
732 aa  342  9e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  34.23 
 
 
720 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  35.27 
 
 
641 aa  342  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  37.02 
 
 
679 aa  342  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  37.56 
 
 
645 aa  340  4e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  34.59 
 
 
655 aa  339  1e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  35.96 
 
 
644 aa  338  2e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  35.37 
 
 
669 aa  338  2e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  34.73 
 
 
775 aa  337  3e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21042e-11 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  36.65 
 
 
714 aa  337  4e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  36.06 
 
 
714 aa  336  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  33.23 
 
 
713 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  33.23 
 
 
713 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  33.23 
 
 
713 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  35.99 
 
 
679 aa  334  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  37.12 
 
 
728 aa  334  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  35.82 
 
 
680 aa  334  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  33.29 
 
 
668 aa  333  5e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  34.88 
 
 
828 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  34.32 
 
 
654 aa  333  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  34.68 
 
 
779 aa  333  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  33.28 
 
 
713 aa  333  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  33.28 
 
 
713 aa  333  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  33.28 
 
 
713 aa  333  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  34.7 
 
 
770 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  34.63 
 
 
776 aa  332  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  36.1 
 
 
658 aa  332  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  32.43 
 
 
714 aa  331  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.26 
 
 
776 aa  331  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  35.99 
 
 
833 aa  330  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  35.78 
 
 
795 aa  328  1e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  4.6818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  37 
 
 
667 aa  329  1e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.44476e-08 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  34.99 
 
 
730 aa  329  1e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  33.81 
 
 
814 aa  329  1e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  31.44 
 
 
801 aa  328  2e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  36.96 
 
 
714 aa  328  2e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  36.82 
 
 
680 aa  328  2e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  35.2 
 
 
763 aa  328  2e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  37.66 
 
 
680 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  1.38665e-10 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  36.82 
 
 
680 aa  327  4e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  6.91863e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  33.04 
 
 
649 aa  327  4e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.95 
 
 
626 aa  327  5e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  36.64 
 
 
673 aa  327  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  36.64 
 
 
673 aa  327  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.33103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34.76 
 
 
761 aa  326  8e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  37.12 
 
 
680 aa  326  8e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  34.5 
 
 
757 aa  326  8e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  35.09 
 
 
741 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  36.94 
 
 
680 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.66869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  32.2 
 
 
710 aa  323  9e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  31.98 
 
 
707 aa  323  9e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  34.26 
 
 
683 aa  323  9e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  32.17 
 
 
714 aa  322  1e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>