More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1879 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1879  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000201387  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  46.74 
 
 
185 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  46.2 
 
 
185 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  45.36 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  44.81 
 
 
189 aa  187  9e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  43.48 
 
 
199 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  44.26 
 
 
189 aa  185  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  45.16 
 
 
188 aa  184  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  43.72 
 
 
210 aa  183  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  42.39 
 
 
193 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  45.65 
 
 
192 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  42.93 
 
 
207 aa  181  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  42.08 
 
 
194 aa  181  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  46.45 
 
 
185 aa  179  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 
187 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  44.62 
 
 
188 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  43.41 
 
 
190 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  43.78 
 
 
207 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  45.93 
 
 
179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  43.01 
 
 
189 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  48.6 
 
 
195 aa  177  4.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  41.53 
 
 
187 aa  177  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  42.08 
 
 
185 aa  177  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  43.01 
 
 
189 aa  177  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  43.01 
 
 
189 aa  177  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  43.01 
 
 
189 aa  177  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  43.01 
 
 
189 aa  177  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  43.01 
 
 
189 aa  177  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  43.01 
 
 
189 aa  177  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  43.01 
 
 
189 aa  177  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  43.01 
 
 
189 aa  177  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  43.01 
 
 
189 aa  177  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  43.01 
 
 
189 aa  177  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  43.17 
 
 
195 aa  177  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  44.26 
 
 
188 aa  177  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  42.62 
 
 
186 aa  176  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  49.71 
 
 
188 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  40.76 
 
 
220 aa  175  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  42.77 
 
 
206 aa  175  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  44.69 
 
 
223 aa  175  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  44.07 
 
 
202 aa  175  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  44.57 
 
 
188 aa  174  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  42.08 
 
 
188 aa  174  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  42.2 
 
 
200 aa  174  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  40.76 
 
 
206 aa  174  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  43.96 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 
200 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  42.93 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  42.16 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  44.51 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  44.51 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  45.05 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  43.41 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  46.78 
 
 
219 aa  171  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  41.3 
 
 
189 aa  171  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  41.3 
 
 
234 aa  171  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  45.56 
 
 
219 aa  170  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  40.22 
 
 
198 aa  170  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  42.08 
 
 
202 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  44.94 
 
 
185 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  42.86 
 
 
190 aa  169  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  46.2 
 
 
218 aa  169  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  46.2 
 
 
216 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  43.65 
 
 
223 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  43.75 
 
 
224 aa  169  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  43.96 
 
 
190 aa  169  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  38.8 
 
 
205 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  40.11 
 
 
206 aa  168  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  45.4 
 
 
193 aa  168  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  40.22 
 
 
202 aa  167  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  43.79 
 
 
257 aa  167  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  41.53 
 
 
200 aa  167  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  41.85 
 
 
214 aa  167  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  40 
 
 
219 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  42.08 
 
 
217 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  40.76 
 
 
216 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  41.57 
 
 
203 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  44.02 
 
 
194 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  39.25 
 
 
214 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  44.44 
 
 
218 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  40.8 
 
 
219 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  40.22 
 
 
209 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 
201 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 
201 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 
201 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0038  GTP cyclohydrolase I  44.51 
 
 
185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  40.22 
 
 
222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  41.53 
 
 
202 aa  164  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 
202 aa  164  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  43.86 
 
 
214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  43.86 
 
 
184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  43.86 
 
 
214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  43.86 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  43.86 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  44.62 
 
 
195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  43.86 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  43.6 
 
 
186 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  43.33 
 
 
226 aa  162  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  44.38 
 
 
185 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  36.22 
 
 
219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>