More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1820 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1820  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 746 aa  1513    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000828965  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0434  DNA topoisomerase I  60.94 
 
 		 768 aa  919    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  48.59 
 
 		 694 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  48.91 
 
 		 693 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  48.05 
 
 		 691 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  46.52 
 
 		 710 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  45.85 
 
 		 693 aa  543  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  47.85 
 
 		 695 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  45.7 
 
 		 697 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  45.97 
 
 		 696 aa  541  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  45.48 
 
 		 702 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  43.33 
 
 		 751 aa  538  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  47.74 
 
 		 706 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  44.64 
 
 		 700 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  47.85 
 
 		 693 aa  530  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  40.1 
 
 		 793 aa  531  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  44.84 
 
 		 697 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  44.48 
 
 		 700 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  43.51 
 
 		 686 aa  528  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  39.01 
 
 		 798 aa  527  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  45.07 
 
 		 696 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  39.76 
 
 		 802 aa  523  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  45.21 
 
 		 690 aa  521  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  46.29 
 
 		 696 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  46.43 
 
 		 706 aa  521  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  39.95 
 
 		 804 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  46.14 
 
 		 691 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  44.37 
 
 		 694 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  39.55 
 
 		 799 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  40.08 
 
 		 798 aa  515  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  41 
 
 		 798 aa  514  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  41.9 
 
 		 711 aa  514  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  43.08 
 
 		 708 aa  513  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  45.7 
 
 		 684 aa  513  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  44.53 
 
 		 692 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  46.59 
 
 		 706 aa  504  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  43.72 
 
 		 691 aa  505  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  46.12 
 
 		 692 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  43.72 
 
 		 691 aa  505  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  46.09 
 
 		 708 aa  505  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  46.41 
 
 		 691 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  43.29 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  44.53 
 
 		 692 aa  502  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  44.23 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  44.38 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  44.23 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  42.1 
 
 		 747 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  44.23 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  40.45 
 
 		 760 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  44.75 
 
 		 703 aa  501  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  44.23 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  45.23 
 
 		 714 aa  501  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  44.23 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  44.75 
 
 		 703 aa  499  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  43.93 
 
 		 692 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  39.34 
 
 		 798 aa  498  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  38.68 
 
 		 831 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  42.72 
 
 		 711 aa  498  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  37.94 
 
 		 853 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  37.93 
 
 		 758 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  38.74 
 
 		 836 aa  495  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  42.98 
 
 		 762 aa  495  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  40.4 
 
 		 746 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  44.7 
 
 		 715 aa  495  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  38.29 
 
 		 831 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  38.29 
 
 		 831 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  43.77 
 
 		 703 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  38.66 
 
 		 789 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  43.63 
 
 		 692 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  38.96 
 
 		 748 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  46.46 
 
 		 702 aa  490  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  44.48 
 
 		 669 aa  489  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  40.49 
 
 		 859 aa  488  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  38.45 
 
 		 780 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  38.51 
 
 		 743 aa  486  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1024  DNA topoisomerase I  43.93 
 
 		 696 aa  486  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.352033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  38.93 
 
 		 756 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  41.3 
 
 		 758 aa  483  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  38.28 
 
 		 813 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  39.3 
 
 		 894 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  37.1 
 
 		 767 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  44.27 
 
 		 633 aa  479  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  38.12 
 
 		 757 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  44.52 
 
 		 633 aa  478  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  43.52 
 
 		 721 aa  474  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  38.48 
 
 		 765 aa  474  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  37.39 
 
 		 865 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  37.39 
 
 		 865 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  37.39 
 
 		 865 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  40.09 
 
 		 841 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  38.07 
 
 		 758 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  37.39 
 
 		 865 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  37.39 
 
 		 865 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  37.39 
 
 		 865 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  37.39 
 
 		 865 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  37.47 
 
 		 865 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  41.89 
 
 		 694 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  36.58 
 
 		 898 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  37.39 
 
 		 865 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  36.95 
 
 		 836 aa  472  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>