More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1800 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  100 
 
 		 455 aa  907    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  35.73 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  35.5 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  35.6 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  36.07 
 
 		 456 aa  269  8e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  34.7 
 
 		 442 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  35.59 
 
 		 466 aa  259  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  35.83 
 
 		 454 aa  257  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  34.27 
 
 		 455 aa  253  7e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  35.25 
 
 		 477 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  36.14 
 
 		 460 aa  246  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  35.07 
 
 		 449 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  37.25 
 
 		 447 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  35.45 
 
 		 447 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  34.27 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  34.96 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  35.56 
 
 		 464 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  35.91 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  32.95 
 
 		 452 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  32.41 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 493 aa  216  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  31.09 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  32.48 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  36.75 
 
 		 466 aa  211  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  32.07 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  35.7 
 
 		 447 aa  206  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 450 aa  203  5e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  30.4 
 
 		 454 aa  202  7e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  29.43 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  28.67 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  29.19 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  28.67 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  29.19 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  30.13 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 451 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  28.67 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  28.21 
 
 		 496 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.67 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  31.68 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  31.31 
 
 		 451 aa  192  8e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  29.16 
 
 		 449 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  30.91 
 
 		 496 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  31.24 
 
 		 447 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  29.24 
 
 		 451 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  29.47 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 456 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  31.44 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  31.96 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.99 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.96 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  29.91 
 
 		 466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.82 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  26.7 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.45 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  29.59 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  25.92 
 
 		 448 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  31.56 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  29.07 
 
 		 445 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  23.85 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  23.77 
 
 		 465 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  26.07 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 452 aa  154  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 439 aa  153  8e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  22.82 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 451 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  25.86 
 
 		 451 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  25.86 
 
 		 451 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  25.52 
 
 		 451 aa  143  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  27.74 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  29.05 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  25.62 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.69 
 
 		 459 aa  137  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 460 aa  136  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  22.7 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>