35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1776 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1776  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  1023    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000652545  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0640  hypothetical protein  60.12 
 
 		 506 aa  624  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0171337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0636  hypothetical protein  59.92 
 
 		 497 aa  621  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1577  hypothetical protein  52.1 
 
 		 514 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0136  hypothetical protein  43.03 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.619185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1873  hypothetical protein  41.74 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.406641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0540  hypothetical protein  42.19 
 
 		 515 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00218193  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4974  hypothetical protein  42.39 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.164186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04222  hypothetical protein  41.78 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4981  hypothetical protein  42.19 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.986087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4615  hypothetical protein  41.78 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4888  hypothetical protein  42.19 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00183026  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4820  hypothetical protein  42.19 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4922  hypothetical protein  42.19 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4928  hypothetical protein  41.99 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3676  hypothetical protein  41.78 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4978  hypothetical protein  41.78 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04256  hypothetical protein  41.78 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137838  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3618  conserved hypothetical protein  41.78 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3943  hypothetical protein  43.03 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0271  hypothetical protein  41.52 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000729096 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02540  hypothetical protein  40.81 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0268  hypothetical protein  40.67 
 
 		 517 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003580  hypothetical protein  40.2 
 
 		 514 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2400  hypothetical protein  40.79 
 
 		 516 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0516423  unclonable  0.0000100852 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1985  hypothetical protein  39.92 
 
 		 522 aa  361  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2066  hypothetical protein  40.59 
 
 		 516 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2283  hypothetical protein  40.08 
 
 		 520 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.02604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2062  hypothetical protein  40.08 
 
 		 520 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000491691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2407  hypothetical protein  39.29 
 
 		 519 aa  353  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.5 
 
 		 676 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  27.66 
 
 		 748 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  27.66 
 
 		 749 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  27.66 
 
 		 749 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  27.85 
 
 		 749 aa  43.1  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>