More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1772 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1772  thioredoxin  100 
 
 
105 aa  216  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000134775  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  53.33 
 
 
105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  49.53 
 
 
108 aa  121  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  51.4 
 
 
104 aa  117  7e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  116  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  47.96 
 
 
109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  46.94 
 
 
109 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  47.57 
 
 
104 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  46.73 
 
 
104 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  46.73 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  47.66 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  46.73 
 
 
104 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  46.73 
 
 
104 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  46.73 
 
 
104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  53.33 
 
 
104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  46.6 
 
 
120 aa  106  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  44.86 
 
 
105 aa  106  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  41.9 
 
 
108 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  44.9 
 
 
109 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  41.12 
 
 
108 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  44.33 
 
 
114 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  41.9 
 
 
108 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  103  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  39.05 
 
 
108 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  103  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  42.86 
 
 
108 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  45.79 
 
 
105 aa  101  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  44.23 
 
 
119 aa  101  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  42.72 
 
 
104 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  47.57 
 
 
102 aa  100  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  37.14 
 
 
108 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  37.14 
 
 
108 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  37.14 
 
 
108 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  43.43 
 
 
100 aa  100  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  46.59 
 
 
113 aa  100  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  41.9 
 
 
108 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  40.4 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  45.74 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  41.75 
 
 
119 aa  99  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  45.36 
 
 
106 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  40.19 
 
 
106 aa  99.4  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  42.27 
 
 
110 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  39.25 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  40.19 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  38.68 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  39.39 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  39.39 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  45.71 
 
 
113 aa  97.1  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  40 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  96.7  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  42 
 
 
136 aa  96.7  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  44.09 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  42.72 
 
 
105 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  42.71 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  36.19 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  40.57 
 
 
110 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  43.3 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  36.89 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  37.14 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  43.01 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  39.81 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  38.32 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  36.79 
 
 
109 aa  94.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  43.3 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  37.25 
 
 
109 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  35.24 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  43.3 
 
 
106 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  35.24 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  50.62 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  44.57 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>