21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1771 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1771  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 
218 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000650244  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0716  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.26 
 
 
217 aa  258  7e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0474  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 
213 aa  219  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0319  N-glycosylase/DNA lyase  42.11 
 
 
215 aa  187  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.542315  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0507  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.89 
 
 
225 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0707  N-glycosylase/DNA lyase  36.92 
 
 
218 aa  136  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0077802  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1106  N-glycosylase/DNA lyase  39.63 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1000  N-glycosylase/DNA lyase  39.17 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0807  N-glycosylase/DNA lyase  36.06 
 
 
208 aa  116  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1811  N-glycosylase/DNA lyase  33.33 
 
 
204 aa  105  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0202  N-glycosylase/DNA lyase  35.58 
 
 
211 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1676  N-glycosylase/DNA lyase  35.03 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.201402  normal  0.189082 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1885  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.01 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.194701  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0692  N-glycosylase/DNA lyase  31.39 
 
 
222 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.871696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3997  HhH-GPD family protein  27.43 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004306  thermostable 8-oxoguanine DNA glycosylase  29.27 
 
 
258 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.345989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0338  hypothetical protein  27.85 
 
 
240 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  32 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  35.11 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  31.96 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  30.17 
 
 
227 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>