More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1583 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  100 
 
 
445 aa  875    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  38.48 
 
 
435 aa  273  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  32.79 
 
 
442 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  33.03 
 
 
440 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  35.89 
 
 
445 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  33.17 
 
 
459 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
452 aa  227  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  30.91 
 
 
451 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  30.73 
 
 
451 aa  226  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  30.73 
 
 
451 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  30.73 
 
 
451 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  30.73 
 
 
451 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  30.68 
 
 
451 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  30.28 
 
 
451 aa  225  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  30.28 
 
 
452 aa  223  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  30.05 
 
 
451 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  31.15 
 
 
440 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.75 
 
 
446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  29.59 
 
 
451 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  33.17 
 
 
450 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  30.58 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  32.24 
 
 
496 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  30.68 
 
 
451 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  33.1 
 
 
452 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  31.32 
 
 
447 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  33.33 
 
 
434 aa  210  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  33.18 
 
 
452 aa  209  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  31.12 
 
 
448 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  29.45 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  29.45 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  30.51 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.61 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  30.24 
 
 
448 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  30.51 
 
 
450 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  30.43 
 
 
450 aa  196  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  33.1 
 
 
447 aa  196  9e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  30.49 
 
 
449 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29 
 
 
451 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  28.77 
 
 
451 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  29.58 
 
 
448 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  28.4 
 
 
458 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  30.94 
 
 
449 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  30.64 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  29.08 
 
 
455 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  31.82 
 
 
446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  29.08 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
442 aa  177  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  30.33 
 
 
467 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  28.25 
 
 
448 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.45 
 
 
459 aa  172  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  30.49 
 
 
456 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.95 
 
 
451 aa  170  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  28.02 
 
 
448 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  28.5 
 
 
461 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  28.21 
 
 
454 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  29.68 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  28.51 
 
 
455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  27.97 
 
 
447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  28.64 
 
 
456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  27.97 
 
 
449 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  28.54 
 
 
446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  29.4 
 
 
454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.5 
 
 
437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  24.32 
 
 
455 aa  163  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  30.1 
 
 
455 aa  163  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27 
 
 
447 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  29.07 
 
 
455 aa  162  9e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
455 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  28.51 
 
 
456 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  29.17 
 
 
442 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  27.52 
 
 
444 aa  158  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
456 aa  157  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.31 
 
 
447 aa  154  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  25.99 
 
 
472 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  25.93 
 
 
449 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  27.62 
 
 
464 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  28.08 
 
 
468 aa  146  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  24.38 
 
 
456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  25.76 
 
 
493 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  25.68 
 
 
465 aa  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  25.52 
 
 
459 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  27.38 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1225  multi anti extrusion protein MatE  25.49 
 
 
439 aa  140  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.874219  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
477 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  25.69 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3521  multi anti extrusion protein MatE  27.39 
 
 
455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  27.98 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  25.96 
 
 
464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  27.9 
 
 
452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  25.53 
 
 
461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  27.58 
 
 
437 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  24.94 
 
 
496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
437 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  23.97 
 
 
452 aa  126  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.12 
 
 
472 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.31 
 
 
439 aa  125  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  24.76 
 
 
454 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  28.47 
 
 
485 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>